此后，数艘美军军舰赶到现场，并且同海盗方面进行了一系列艰苦的谈判。由于美方坚持要在确保人质安全的同时，将4名涉及此事的海盗“逮捕法办”；而索马里一方认为“这一条件是不能接受的”。海盗们还很嚣张，说只要美军动用武力，强行解救人质菲利普斯，就会杀死他。

由于海盗们乘坐的救生艇缺乏燃料，失去了动力，因此只能在索马里东部的印度洋茫茫海面上“漂流”，距离索马里海岸线最近时只有50公里左右。只要他们成功上岸，就将回到“海盗老窝”的怀抱，解决此事将变得更为困难。美军因此采取了一切必要措施，一方面阻止海盗的“增援部队”赶赴现场，一方面始终让这条小船处于自己的有效监控范围内，使其没有带着人质登陆的可能。但人质在对方手中，他们投鼠忌器，只能多日与海盗处于对峙状态。

为防止海盗带着其他被劫持的外国货轮与船员赶往现场“助威”，美军参与营救的7艘军舰和P-3侦察飞机采取了各种措施，全力阻止海盗的“增援部队”抵达该救生艇附近海域。一艘计划前往助阵的被劫持德国万吨货轮，因“找不到救生艇位置”，只好重返其陆上基地附近。

海盗们曾要求美方通过支付200万美元的赎金外加提供安全通道的方式，来换取菲利普斯的安全。此前，其他国家为被俘万吨货船提供的赎金最多也不过300万美元，海盗本次可谓“狮子大张口”。

现在，同美方谈判的海盗已经被捕。有关方面（如美国司法部）正在考虑，是否在美国本土起诉这名海盗。如果根据美国法律审判海盗，此人将被判处无期徒刑。

美国人对索马里有着极为“黑色的记忆”。1993年，美军特种兵在索马里首都摩加迪沙同当地民兵武装展开巷战，结果造成18名官兵伤亡和多架直升机坠毁的惨剧。后来，美国时任总统克林顿宣布从索马里撤走全部美军。美国从此不愿再涉足这个战乱不止、多灾多难的“东非之角”。

统计数字显示，现在世界各国悬挂美国国旗的远洋货轮，总数不到200艘。上述这艘排水量达17万吨的集装箱货轮上，共装有400多个满载食品的集装箱，其中有232个集装箱属于联合国有关机构向索马里和乌干达等国难民提供的食品援助。这条船于12日已经抵达了预定港口卸货。

美国曾多次宣称，他们不会通过向“邪恶势力”支付赎金的方式来换取人质的安全。因此，虽然菲利普斯是自19世纪初至今的200多年里第一名被海盗俘虏的美国水手，有关方面还是宣称将拒绝接受对方提出的各种条件。万幸的是，菲利普斯最终平安无恙，已被送到美军军舰上接受各类治疗和调养。毕竟，海盗不会轻易将其杀害，否则他们就失去了最好的“防身武器”。

美国海军预计，即使不去索马里东部的印度洋巡逻，仍然至少需要61艘军舰才能确保海盗最为猖獗的亚丁湾水域畅通无阻。美军中央司令部司令彼得雷乌斯4月9日承诺，美国将增加在“东非之角”的海军兵力。他没有介绍具体情况，但是他表示：“我们将确保，我们拥有未来几天可能需要的所有能力。”

不过，海盗们也叫来了增援力量。一位不愿透露姓名的驻肯尼亚首都内罗毕的外交官说：“海盗们已叫来了帮手，小艇和母船正从海岸驶往出事海区。我们知道，他们进行了集结。”海盗据点艾尔镇的一位居民说，4艘被海盗劫持的外国船只正驶向救生艇，其中的两艘船上有54名人质。

一位名叫巴多威的海盗说：“他们要求我们增援，我们已派去了数名装备精良的同事，这些同事扣押着德国货船。我们无意伤害美国船长，我们希望我们的同事不要遭到伤害。我们需要的首先是一条带着船长出逃的安全路线，随后再进行赎金的谈判。”

目前，索马里当地只有12~16艘来自不同国家的军舰在开展护航行动，给海盗留下了巨大“活动空间”。如何处理那些被俘海盗，也是一个难题。最近，索马里海盗的活动范围最远已抵达非洲东南部的莫桑比克海峡附近。他们目前仍关押着世界各国的270多名人质。

据中新网4月13日电，美联社消息说，索马里海盗头目当天声称美军在“搞偷袭”，他们扬言将对美国展开报复。但该头目并没有透露即将展开海盗活动的细节。

而且，据新华网快讯，肯尼亚当地一个海事组织说，4月12日，就在海盗们同美国方面在索马里东部的印度洋上讨价还价的同时，另一伙海盗却在亚丁湾各国海军眼皮底下再度出手，成功劫持了一艘前往苏伊士运河的拖船（由美国公司所有，悬挂意大利国旗），并将船上16名船员扣为人质，其中包括10名意大利人、5名罗马尼亚人和1名克罗地亚人。4月13日，该船已经被海盗释放，抵达索马里港口抛锚。

分析人士说，索马里海盗在多国军舰的威慑下沉寂了一段时间后，最近又有卷土重来的趋势。近10日之内，该附近海域已先后发生7次海盗袭击过往轮船事件。4月4日，索马里海盗在印度洋上劫持1艘德国货轮；5日，1艘悬挂法国国旗的船只和1艘也门船也被索马里海盗劫持；6日，索马里海盗还劫持了1艘中国台湾渔船和1艘英国万吨级散装货船。10日，法国海军曾对被索马里海盗扣押的5名该国人质展开营救行动，结果成功救出4人，1人在交火中丧生。

索马里海盗再度猖獗，其原因不外乎：1天气转好，海盗作案容易；2海盗开始与军舰“躲猫猫”；3各国舰队协同作战不够。

有专家认为，打击海盗，除了需要舰队护航外，还需要做其他工作。美国第五舰队军官说：“只有国际舰队，绝对不可能完成打击海盗的任务。”观察人士也认为，遏制索马里海盗，必须解决海盗产生的土壤。目前索马里仍然四分五裂，战乱不断，很多人除了做海盗就没有其他事可做——更何况这还是一个暴利行业。