作品出版在即，此时的韩寒更加不在乎学校的纪律，在个人寝室里过着逍遥自在的生活。学校终于无法忍受，3月18日，校方打电话通知韩寒家长有时间到学校来一趟。三天后，韩父忐忑不安地来到了松江二中。首先，校领导详细讲述韩寒在校期间的各种违纪情况：上课迟到，上课后要么睡觉要么看课外书，寝室里也十分的乱……在列举完表现后，开始说实质问题。校领导表示：按他的表现是应该给处分的，然而此前在与韩寒谈话时对方立即表示“那给好了”，所以给处分也解决不了任何问题。而且目前韩寒的成绩可能仍然无法及格，按照学校规定就要退学或者转学。学校经过专门研究，提出一个方案，安排韩寒休学一年，学校为其保留学籍一年，如果一年后，韩寒走不出自己的路，还可以回来继续上学。

谈到这里，韩寒也被找来了，韩父征求他意见时，他表示愿意休学。韩父略作思考，也表示同意。于是，父子俩便回家了。在回去的路上，韩寒对父亲说：“爸爸，你放心，我会作出点成绩来证明自己的。别人看不起我，我自己要看得起自己。再说我又不是一点没有理科知识，将来用得到的，我会自己学的。”

回到家里，韩寒的母亲对父子俩的“疯狂”举动很不接受，在韩父给她作了半夜的思想工作后，才稍微好了些。韩寒按照学校的要求，写了封休学申请书，周末回家后由父亲签了字交给了学校。4月4日，韩父又被叫到了学校，在确认了申请书是其亲笔签名后便办理了正式的休学手续。第二天，韩寒的母亲和舅舅一起来接他回家。离校他只带了些自己喜欢读的书以及数万份全国各地中学生的来信。回家后不到一周，一直很关心韩寒的萌芽杂志的赵老师给了他一个“《萌芽》杂志特约记者”的头衔，因为以前听说其想出去采风，所以希望这个“头衔”能让他方便一点。听说韩寒计划去山西一个贫困县采访后，赵老师又立即给山西省作协主席写了一封信，请他关照韩寒。

在家里休息了几天后，韩寒决定开始人生第一次独自出远门，目的地：北京。主要是去处理《三重门》发行前最后一些事宜。2000年4月23日韩寒独自踏上了开往北京的K14次列车。韩寒下了火车后，打通了袁敏的电话，很快他们见面，袁敏给韩寒看了他期待已久的《三重门》的封面，当晚安排他住在中国作家协会的一个宾馆。在得知韩寒此次北上是向父母“借钱”后，袁敏就给他预支了5000元稿费，书还未出版就给作者预支稿费这在老字号的作家出版社的历史上还是第一次。本来按照惯例，作者来京洽谈出版事宜的时候，旅费及住宿费可以由出版社报销，但是韩寒拒绝了报销。因为作家出版社送了他许多书，已经不方便去山西，于是几天后他改道去了近一些的张家口市怀安县，完成采访后他于30日回到了北京。毕竟是第一次出远门，在火车站买票的过程里，韩寒先是被一位民工模样的人骗走了几十元的IC卡，接着又被一对30多岁的“外地教师”骗走了几十元，再接着又被一个学生模样的人骗走了几十元，善良的韩寒在听到骗子学生的“悲惨”遭遇后还带其吃了顿麦当劳。5月2日，韩寒回到金山家中。

历经一年坎坷，《三重门》终于在2000年5月出版了。该书由北京大学博士生导师曹文轩教授作序。《三重门》首印了3万册，上市三天即售空，出版社立即组织加印。很快，加印的5万册也销售一空，于是再次加印。