云门大师在十七年的游访中，除参访了临济、曹洞和雪峰门下的诸多尊宿外，还与另一些尊宿交游，但在灯录中尚未查询到他们的师门出处，如浙中蕴和尚、梁家庵主、共相和尚、卧龙和尚（若是新罗卧龙和尚，则是石霜庆诸禅师的法孙）等，恕不一一列举。其时云门大师到江州去看望当年的那位陈操尚书，因这一段精彩深刻，故录于下：

师到江州，有陈尚书请师斋。相见便问：“儒书中即不问，三乘十二分教自有座主，作么生是衲僧行脚事？”师问：“曾问几人来？”（尚）书云：“即今同上座。”师云：“即今且置，作么生是教意？”书云：“黄卷赤轴。”师云：“这个是文字语言，作么生是教意？”书云：“口欲谈而辞丧，心欲缘而虑忘。”师云：“口欲谈而辞丧，为对有言；心欲缘而虑忘，为对妄想。作么生是教意？”尚书无语。师云：“见说尚书看《法华经》是不？”书云：“是。”师云：“经中道，一切治生产业，皆与实相不相违背。且道，非非想天有几人退位？”书无语。师云：“尚书且莫草草，十经五论，师僧抛却，却特入丛林，十年二十年尚不奈何，尚书又争得会！”尚书礼拜，云：“某甲罪过。”

云门大师当年在睦州时曾在陈操府中住了三年，同是陈尊宿的弟子，关系非同一般，故可放开脸面无话不谈。此时陈操已由侍郎升为尚书（唐时侍郎尚书的职权远非明清之时可比，且多为虚衔，或去世后的追封），职务也从小小的睦州刺史升为大都会的江州（即今江西九江市）刺史了。陈操为尽地主之谊，办斋为云门大师接风，并勘验他这些年来有何进境。但此时的云门大师，早非当年初出茅庐的境象，绕了几个圈子，便使陈操在不知不觉之中落入了云门大师所布下的口袋中。“作么生是教意？”只有外行才把宗（禅）和教（经论）看作二途。不通宗的人，决不明白佛教经论中的旨趣；同样，不通教，不明白佛教经论旨趣的，能称为通宗吗？面对云门大师的紧逼，陈操不失身份地说：“口欲谈而辞丧，心欲缘而虑忘”——我刚要说的时候，却找不到表达它的语言；思考它的时候，却把思维的本身都忘记了。在这里，陈操仍保持着禅者的身份，所答也很得体。但云门大师的禅却如同利刃，仍在其中找到破绽而乘隙下手：“口欲谈而辞丧，为对有言；心欲缘而虑忘，为对妄想。作么生是教意？”在这里，云门大师把陈操逼入了死胡同。进一步又借用《法华经》中谈“实相”的比喻，再一次使陈操哑口无言。最后，云门大师说：“尚书且莫草草，十经五论，师僧抛却，却特入丛林，十年二十年尚不奈何，尚书又争得会！”这是实修实证后的如实之语。陈操接待过各种各样的僧人，对此原有同感，这时他才真的心悦诚服，对云门大师说：“某甲罪过。”陈操早是禅内的行家里手，平常的禅僧对他是敬畏有加，只是这时的云门大师，已是禅门的顶极高手了，陈操自然会败下阵来。

在云门大师游访期间，唐帝国由极衰而至灭亡。在雪峰禅师圆寂的前一年（907），朱温篡唐称帝，国号为梁，史称后梁。后梁乾化元年（911），云门大师四十八岁时，游方至岭南，到韶州曹溪（今南华寺）礼拜六祖大师真身。又因慕如敏禅师之名，前往灵树禅院（在今韶关境内，具体地点待考）参叩。

灵树如敏禅师（？—918）是一位神奇的禅师，出自长庆大安禅师门下，而长庆大安禅师则是百丈怀海禅师的弟子，曾助沩山灵祐禅师开创沩山（今湖南宁乡县境内），并在灵祐禅师圆寂后接任住持。长庆大安禅师门下甚多禅行奇特的弟子，如被蜀王王衍礼为“神照大师”的大随法真禅师，那位以“三十年来寻剑客，几回落叶又抽枝。自从一见桃花后，直至如今更不疑”的见道偈而著称的灵云志勤禅师，当然还有这位被南汉王礼为“知圣大师”，并以“神通”而预知云门大师的灵树如敏禅师。对这位禅师，各种灯录皆有其机语的记载，而《宋高僧传》则把如敏禅师放在《感通篇》内。兹录于下：

释如敏，闽人也。始见安禅师，遂盛化岭外，诚多异迹。其为人也，宽绰纯笃，无故寡言，深悯迷愚，率行激劝。刘氏偏霸番禺，每迎召敏入请问，多逆知其来，验同合契。广主奕世奉以周旋，时时礼见，有疑不决，直往询访。敏亦无嫌忌，启发口占，然皆准的，时谓之为乞愿，乃私署为知圣大师……后终于住院，全身不散，丧塔官供，今号灵树禅师真身塔是欤！