戴笠得知此案的幕后交易之后，勃然大怒。他算过一笔账，林世良的那批走私物资，按时价可达6000万法币之巨，照国民党的辑私条例规定，此案破获货物充公，军统便可得十分之一的奖金。但若林世良不被判死刑，货不充公，这笔账就会落空。无论于公于私，戴笠都没有放过林世良的道理。

刚好在这段时间，美国总统罗斯福的特使威尔斯到中国访问，他转达了美国政界对国民党的腐败、混乱、贪污、走私等问题的抨击，建议蒋介石进行改革。戴笠立刻瞅准这个机会，罗列了林世良“滥用职权、勾结不法奸商走私、大发国难财”等罪状，以触怒蒋介石，拿林世良开刀。

这个时候，蒋介石一看到林世良的种种不法情形的报告后，骂了一句“娘希匹”，然后毫不犹豫地在原判上批下了“立即枪决”四个字。戴笠知道蒋介石的家族观念高于一切，于是就抢先孔家一步，获取了这个批示。他伯夜长梦多，待孔家知晓后再次设法营救，到时蒋介石很有可能又改变主意，于是，没等孔家回过神来，连夜开刀，立斩林世良。就这样，想救也晚了。孔样熙就这样和军统结下了梁子。

在这些人中，毛人凤准备先向陈诚示好，一来目前蒋介石比较宠信陈诚，二来是因为他俩还有点交情。抗战期间，毛人凤和陈诚同住在军统局员本部隔壁的杨森在重庆的房子里。他们每天进出见面的时候，尽管毛很客气有礼貌地向陈诚打招呼，陈诚总是爱理不理地看一下，彼此极少交谈，但心里还是觉得他和戴笠是有所区别的。

戴笠死后，陈诚比过去更有权势，作为蒋介石面前最得宠的新贵，他把一腔怨气全发在军统身上，欲将其置之死地而后快。

据说每次军政大会，陈诚都当着蒋介石的面嚷嚷道：“军统是什么玩意！他们在抗战中所搞的那一套全是一些散兵游勇式的把戏。在打仗方面，连土匪都不如，可伸手要钱却是行家里手，什么美援、走私、绑票样样都能拿手。当然到手的钱也就浪费掉，这样的组织钱花了不少，效果却没有一点，不如取消算了。”

毛人凤感觉到，如果不和陈诚疏通关系，凭借他在国民党内的地位，十个军统也要被他吃了。从那以后，他便决心要想尽一切办法来缓和陈诚对军统的恶感。他除了低声下气地去请教之外，还送去了各种名义上的钱财，更托杨森去和陈诚拉关系，可是收效仍不大。