东路军向东经过屈裂儿河（即归勒里河）、涛遇河（即洮儿河），乘势扫荡了盘踞在这一带的兀良哈人。谁知天有不测风云，朱棣在班师时忽然患病，6月18日病逝于榆木川（即乌珠穆沁部东南一带）。

明军秘不发丧。从征的大学士杨荣、太监海涛驰归北京，禀告皇太子。7月27日，东西两路军队于武平镇会师。8月1日，将士们奉着朱棣的灵辇经过开平、威虏城、西凉亭、隰宁、云州、东城、雕鄂、怀来、居庸关回到了北京。

朱棣死后，明仁宗继位，改号“洪熙”。阿鲁台于洪熙元年遣使来贡马，弥补双方的关系。同时，明仁宗宣布赦免兀良哈之罪，恢复正常往来。战争虽然暂告一段落，但是鞑靼却在战乱中损耗甚巨，更加削弱。这为后来瓦剌统一蒙古创造了条件。