卡纳里斯建立起纳粹的军事王国后，为希特勒的二战立下汗马功劳，其间的谍报活动成果很多，比较著名的有以下这些：

对英国的谍报战争取得骄人成绩。先后破获了英国在荷兰和德国的间谍网。前者是通过派遣一个得力干将来到英国谍报机构MI－6在欧洲大陆的活动中心海牙，先设法策反一个为英国情报机构服务的荷兰人，并通过这个双重间谍找到了为英国服务的其他间谍。后者是1935年，在德国基尔船厂擒获一名超级特务，此特务埋伏时间长，自一战后一直向英国发送德国最新的海军秘密，最终被擒获意味着英国间谍网在荷兰的终结。德国对英国的情报工作起步较晚，因为希特勒有个奇怪的念头，为了维持友好关系而制止在英进行情报活动，这种局面直到1937年才改变。卡纳里斯在1937年直至战争爆发前，在英国安插各式各样的特务不下253名，其中包括几名安插在英国高级官员家的佣人。1939年9月第二次世界大战爆发后，卡纳里斯发表战争通报：要求分布在世界各地的3000名间谍注重搜集英国特工机构的情报。迅速建立起的有效情报网，使德国军事谍报局和德国其他的情报分析家基本上对英国的战争能力有了清晰的了解，帮了德国总参谋部的大忙。对此卡纳里斯1938年的话是最好的注脚：“不仅英国沿岸的设施，而且大多数机场，还包括从伦敦到北海港口赫尔之间的油料贮存仓库，我们都画有详细的地图。”他甚至弄到了英国陆空军的协作计划，让希特勒也惊叹不已。

卡纳里斯还领导德国军事谍报局二处建立了一支大名鼎鼎的特种部队——勃兰登堡分队。这支队伍荟萃了熟悉各种外语的间谍人才，里面的成员至少都能熟练运用一种外语。捷克语、波兰语、乌克兰语、英语、葡萄牙语、西班牙语、俄语等基本包括了当时世界上的大部分语言，甚至还有冷僻的藏语和阿富汗语。掌握多种语言便使他的间谍触角遍布全世界，甚至到过西藏；而勃兰登堡分队队员熟练掌握侦探地区当地语言，更熟知执行任务区域的风俗习惯，一进入苏联就知道“如何像俄国人一样吐唾沫”。再加上秘密行动和自我生存的技巧，在1939年的波兰战役和1940年的西欧战役以及以后的苏联战场立下赫赫战功。最突出的证明是在一个600人的部队中，竟有3／4的人获得了铁十字勋章。这支队伍最终随着卡纳里斯的下台而被奥宁堡部队取代。

卡纳里斯同时还在情报政治中发挥很大作用，尤其在“希姆莱计划”中扮演了一个极其不光彩的角色：党卫军的秘密警察将利用集中营里的死囚穿着波兰陆军制服向靠近波兰边境格莱维茨地方的德国广播电台发动假进攻。正是卡纳里斯，虽然不情愿，还是把150套波军制服交给了海德里希，并任由后者挑起了第二次世界大战。