布哈林和托洛茨基因为一些意见分歧，积怨渐深，最后分道扬镳了。在反对托洛茨基《十月的教训》的运动中，布哈林站在攻击者的最前列，不再保护他了。布哈林跟斯大林的关系，在党的机关反对联合反对派的斗争年代，非常好，只是在左派反对派被开除出党后，形势一下变化了，因为布哈林是“右派”最有名的首领，当时斯大林与“右派”的矛盾正在越积越深。这影响了他后来的命运走向。

1938年布哈林受到斯大林的法官们的审判。他无疑是在从1936年起就没有申诉的可能的情况下被判刑。他在被捕前以及被捕后遭到不断的审讯。他是一个被控告的叛逆者，他甚至多次打断国家检察长维辛斯基的讲话，使之狼狈不堪。那些虚假的证据、污蔑的证词，几乎全部来自于国家安全总局，而此时国家安全局的领导人正是叶若夫，但是影响安全局工作的那就只有斯大林了。

50年之后，苏联高院决定撤销50年以前对布哈林、季可夫等人的判决。因为他们根本没有犯罪，案子不能成立。布哈林“被重新恢复了党籍”，沉冤终于昭雪。