《杀鬼》的故事背景设定在台湾日据时期、国民政府光复时期与二二八大混乱顺序发生的1941-1947年。小说主角是小名“帕”的台湾原住民,生来力大无穷,且拥有阴阳眼,既能看到鬼,又能与神通灵。因从小接受纯日本教育,二战时期帕被日本中佐收为义子,发誓效忠天皇。后作为特训白虎队成员赴前线参战,中途却被充满神性的大霸尖山施以魔法,困在深山直到终战,帕保住了性命但也失去一只眼睛和耳朵。日本战败后,国民党军队又想征召帕入伍,帕的爷爷认识到只要有战争,帕就是害人的魔鬼,因此当众砍下他的右臂,阻止他再次从军。随后,为了消除帕曾当过日本军人的纪录以让他安稳度日,爷爷带着帕远上台北伪造死亡证明。不料遇到二二八大混乱,二人逃回家乡途中,爷爷被误以为是内地人,被人推落桥下死亡。帕成为孤儿,游走于人、鬼、神之间,开始审视国族与战争的意义。