毛泽东身为农讲所所长，负责处理所务工作外，还亲自给学生讲课。他讲授“中国农民问题”、“农村教育”、“地理”三门课，运用马克思主义的立场、观点，阐述中国革命的具体问题。毛泽东在讲课中，根据中国的历史和当时的实际情况，从人口、生产、革命力量、战争关系、革命目的等五个方面论述中国农民在国民革命中的重要地位。他指出：“国民革命的目标是要解决工农商学各阶级问题，设不能解决农民问题，则各阶级的问题无由解决，故国民革命大部分是解决农民问题，其余问题皆不如农民问题重要。”毛泽东还进一步指出农民问题的具体内容：1.土地问题；2.地租问题；3.田赋问题；4.高利贷问题；5.苛税问题；6.苛捐问题；7.昂贵的工业品和低廉的农产品；8.天灾问题；9.资本匮乏；10.政治问题；11.文化问题；12.失业问题。

毛泽东非常注重培养学生分析问题、解决问题的能力，更提倡学生从事实际问题的调查研究。7月间，他曾组织50多个学生赴韶关学习一星期。8月，又组织全体师生赴海丰实习两星期。他把学生按来自不同的省区，组成“安徽、江西、湖南、湖北、四川、云贵、两广、福建、浙江、山东、奉直、豫陕、三个特别区等十三个农民问题研究会”，并拟出36个调查项目，“引导学生开始研究实际问题”。这36个研究项目是：1.租率；2.主佃关系；3.抗租减租平粜等风潮；4.利率；5.拖欠逼账及烂账等情形；6.田赋；7.抗粮情形；8.厘金、杂税、杂捐及临时捐；9.自耕农、半自耕农、佃农、雇农数目之比较；10.地主的来源；11.货物价格与农业价格之比较；12.工价；13.失业情形；14.祠堂组织及族政情形；15.地方公会组织及财产状况；16.地方政治组织；17.地方政治情形；18.会党及土匪；19.团防情形；20.教育状况；21.销售何种洋货影响如何；22.兵祸及其影响；23.天灾及其影响；24.贪官污吏及其影响；25.烟赌偷抢各种情形；26.出产什么及其销售地；27.妇女的地位；28.农民的观点及感想；29.从前与现在地价之比较；30.从前与现在农产品价格之比较；31.农村组织状况；32.地质之肥饶；33.宗教信仰状况；34.度量衡；35.民歌；36.成语。学生通过理论学习，又把理论用到实际研究中去，“亲入革命的农民群众中，考察其组织，而且与其生活，影响学生做农民运动的决心极大”。

毛泽东把学生社会实践的调查报告、总结报告，审核、修改后，编入他主编的《农民问题丛刊》正式出版，供全国从事农民运动的同志参考。丛刊原拟出版52种，至1926年11月，已出版了17种，后来还陆续出版了一些。毛泽东为丛刊写了序言《国民革命与农民运动》。这是一篇关于农民问题的重要理论著作，核心思想是：“农民问题乃国民革命的中心问题，农民不起来参加并拥护国民革命，国民革命不会成功；农民运动不迅速地做起来，农民问题不会解决；农民问题不在现在的革命运动中得到相当的解决，农民不会拥护这个革命。”毛泽东说：经济落后的半殖民地，帝国主义和封建统治阶级压迫榨取的对象是农民。他们能够实现其压迫与榨取则全靠那封建地主阶级给他们以死力的拥护，否则无法行其压榨。所以经济落后的半殖民地的农村封建阶级，乃是国内统治阶级国外帝国主义唯一坚实的基础。不动摇这个基础，便万万不能动摇这个基础的上层建筑。中国的军阀是这些乡村封建阶级的首领，说要打倒军阀而不打倒乡村的封建阶级，是不知道轻重本末。毛泽东高度赞扬彭湃领导的广东海陆丰农民运动。他说，陈炯明的故乡，是历来土豪劣绅贪官污吏云集的海丰县，自从有了五万户二十万人之县农民协会，便比任何县都清明——县知事不敢为恶，征收官吏不敢额外刮钱，全县没有土匪，土豪劣绅鱼肉人民的事几乎绝迹。毛泽东号召大家要学习海丰，不辞劳苦地深入农村开展农民运动。

为培养学生吃苦耐劳精神和英勇顽强的革命意志，毛泽东十分重视学生的军事训练。他说：搞革命就是刀对刀，枪对枪，要推翻地主武装——团防局，就必须建立农民自己的武装，刀把子不掌握在自己人手里，就会出乱子。毛泽东还指出：农民占全国人口的大多数，但是，现在他们没有土地，没有教育，没有武装，中国革命还不能成功。农讲所专门设置军事训练课，负责管理学生军训工作。军训时间占全课程的三分之一，训练项目有：队列操练、持枪、刺杀、瞄准、实弹射击，利用地形地物进行森林山地战、村落战的训练，还进行夜间演习等。学生在学习期间过着艰苦的紧张活泼的军事生活，为日后从事复杂而艰辛的农民运动打下了基础。

第六届农民运动讲习所学生于1926年9月11日结业。毛泽东在结业式上作了长篇讲话。他总结农讲所开办以来的工作，指明当前农民运动的迫切任务，勉励学员“拜农民为老师，同农民做朋友，脱掉知识分子的衣服，放下臭架子；敢于同反动势力作斗争，不怕艰苦、不怕牺牲，为农民求解放，为农民谋利益，这才是我们的好学生。”至10月5日，第六届农讲所所有学员除三人因病未回外，均回到原籍，投入工作。从而，推动了全国农民运动的迅猛发展，推动了中国农村大革命的进程。

1925年10月，中共中央在北京召开四届二次扩大执行委员会会议，会议决定在中央执委会之下设立职工运动、农民运动及军事运动委员会。

中央农委成立之时，毛泽东正筹办广州农民运动讲习所，事务繁多，抽不出身。第六届农讲所刚结束，中共中央即通知毛泽东赴上海出任中共中央农民运动委员会书记。1926年11月，毛泽东偕杨开慧到上海赴任。中共中央局和共产国际代表联席会议拟定的《中国共产党关于农民政纲之草案》记载：“中央农民运动委员会，自去年扩大会议议决设立后，因种种困难原因，组织迄未完备，十一月中，毛泽东来任中央农委书记，始正式决定以阮、彭、易、陆、萧、CY二人合作并组成中央农委，以委员一人驻局办事，另在汉口设办事处，就便指导湘、鄂、豫、赣、川农运工作。”