同仁堂更有一批完全自创的药，用今天的话说，就是“具有自主知识产权”的药。乐平泉就是一位勇于创新的人物。他不仅凭不断地研制新药，用小小的广仁堂挤走了董启泰，夺回了同仁堂的经营权，而且为同仁堂创出了一批至今仍畅销不衰的名药，其中有虎骨酒、安坤赞育丸、益仙救苦金丹、八宝药墨、五味槟榔、定喘丸、参茸酒、如意长生酒等。后代曾经这样赞扬他：“情殷济世，更于公余之暇，广求活人之方。”可见他是一位品德高尚，孜孜不倦的药学家。他的后代还特别指出：“凡此等类，皆系先大夫印川公虔诚创造，屡奏奇功，实古方所未备，用弥秘而不授人者也。”也就是说，这些药都是从前没有的，是乐平泉创造的，其中许多至今还是同仁堂长销不衰的名品。

此外，著名的“乌鸡白凤丸”是同仁堂的第四代传人乐百龄创制。当时，乐家正处于困难的境地，同仁堂已经交由他姓经营，乐家只是挂一个铺东的名义。一天，他在翻看明朝人写的《寿世保元》一书时，发现“带下篇”中有“白凤丹”的处方，而此书的“虚劳篇”中，也有“白凤丹”的处方，他再翻到“调经诸方”中，又发现这里有“乌鸡丸”的处方。乐百龄反复研究这三个方子，他想：“它们都是治疗妇科病的，各有长短，能不能把这三个方子变成一个方子呢？”于是，乐百龄反复思考，比较三个方子中的用药成分，最后终于配出了“乌鸡白凤丸”。它药性平和，不寒不燥，成为治疗妇女气血两亏的名药。

新中国成立后，古老的同仁堂获得了新生。为了更好地为人民群众的健康服务，同仁堂自新中国成立初期就努力探索中药剂型的创新。中药有着几千年的传统历史，虽然它的疗效不错，但是从它的感观、外形和服用方便程度来讲，和西药相比较还存在着差距。同仁堂的十大王牌，如安宫牛黄丸、牛黄清心丸、同仁大活络丸、国公酒、乌鸡白凤丸等，疗效非常好，就是服用起来不大方便。在彭真市长的支持下，乐松生请郑启栋教授对中药进行剂型改进，就是有益的尝试和良好的开端。

同仁堂集团成立后，尤其是股改上市后，更是加大了对科技创新的投入力度。他们还制定了这样一个创新原则：“遵古不泥古，创新不离宗。”也就是说，尊重传统，但又不为传统束缚；勇于创新，但又注重继承优秀的历史遗产。这个原则适用于中药的开发和创新，也适于其他方面的创新。

在这个原则下，同仁堂把大药丸子改成了片剂、水蜜丸或水丸，这样不仅便于服用，同时，也扩大了用药的患者人群。比如六味地黄丸，它对老年人比较适应，但是中年人和年轻人就没有时间和耐性去嚼大药丸子。同仁堂的科研人员把它改成了一种比较小的颗粒，后来又开发出浓缩丸。市场的信息反馈表明，中青年人对它的反映也非常好。

乌鸡白凤丸是同仁堂的名牌产品，深受欢迎。但是药丸大，携带和服用都不方便，对女性来说更是如此。同仁堂把它改为口服液和胶囊，既保持了原有的疗效，又克服了丸药的缺点，投放市场后，深受患者的欢迎。

同仁堂还开发出了喷雾剂、滴丸等中药新剂型，如速效心痛宁滴丸、冠心苏合滴丸、愈风宁心滴丸、速效心痛宁气雾剂等，大大方便了病患者用药，更不知挽救了多少人的生命，为多少人争回了健康和幸福。