7月1日，国民政府成立。汪精卫、胡汉民、许崇智、廖仲恺等16人当选为政府委员，汪精卫、胡汉民、许崇智、谭延闿、林森当选为常务委员，许崇智出任军事部长，胡汉民担任外交部长。

当天，国民政府召开会议，鲍罗廷以总顾问的身份参加会议，并且控制了会议的选举。在鲍罗廷的支持下，汪精卫以全票当选为国民政府主席，成了孙中山逝世后国民党新的政治和军事领袖，他同时又是国民党中央执行委员会主席和常务委员会主席。此外，胡汉民和廖仲恺也都成了政治核心人物。

蒋介石只是在7月3日成立的军事委员会里当了一名委员，主席则是汪精卫。蒋介石对这样的结果感到不满。因此，他对军事委员会的工作表现得并不积极，“远远地呆在黄埔岛上，培植军校力量，打算有朝一日利用他们为其私利效劳。”尽管广东政府已经任命蒋介石为广州卫戍司令，但他迟迟不肯就职，甚至提出辞去所有职务。

7月7日，蒋介石向军事委员会提出六条建议：（1）发展西南革命势力，以抗拒帝国主义；（2）革除军队积弊；（3）统一财政；（4）整理军队；（5）利用罢工工人建筑道路；（6）统一两广。

这六条建议当中，关键的是统一军事和统一财政。蒋介石提出的这几条建议，矛头是指向许崇智的，其目的是想通过整顿军队，把军权集中到军事委员会，以削弱许崇智的力量。这六条建议得到汪精卫的赞同，并在军事委员会的会议上作出了相应的决议。

就在这天，加伦离开了广州。其中的原因，当事人有两种说法。苏联驻北京代表加拉罕解释说，加伦中断在华顾问使命，是因为“他完全病倒了，继续留在广州是绝对不行的。”但是，据中共方面的分析，加伦离开广州另有隐情。中共中央依据张国焘送来的报告，认为这是“鲍罗廷和加伦发生歧见所致”。据张太雷分析，由于“加伦主张支持许崇智为军事首脑，建立军事委员会制度；而鲍罗廷则主张支持蒋介石；结果由莫斯科裁定，否定了加伦的意见。”