但东北野战军于5月外围战失利后，林彪认为，长春守军的战斗力和防御攻势，都比原来估计的要强，夺取条件还不成熟。因此于5月29日致电军委：“我们建议改变硬攻长春的决心。”6月5日，未等军委回电，他又提出东北野战军三个行动方案，认为目前即正式进攻长春，“成功的可能较少，不成功的可能则较多”，最可行的是“对长春采取较长的围城打援然后攻城的办法。时间准备两个月到四个月。……这一行动除多费去几个月的时间以外，没有其他坏处，但能有把握的歼灭敌人和拿下长春”。毛泽东于6月7日复电基本同意林彪的方案，并要求“精心组织这次战役”。

但到9月12日，长春被围困了半年后依然没有攻下来。出现了东北野战军70余万大军被10万国民党军牵制于长春地区，同守军对峙的僵局，攻撤两难。蒋介石用一座孤城“钳制共军大批主力南下”的企图竟得以实现。

此一阶段，关内各战场上的野战军在处于兵力劣势情况下，频频主动反击国民党军。粟裕向军委建议集中主力在江北打大歼灭战。在敌强我弱的情况下，率华东野战军10万余人于1948年6月至7月发起豫东战役，歼灭国民党军近10万人，改变了中原战局。林彪闻讯后，说：“取胜把握至多五成，在这么困难的条件下，打了这么大的胜仗，不简单。”9月，粟裕又率华东野战军全军32万人发起济南战役，攻克国民党重兵把守、坚固设防的山东省会济南城，歼灭国民党军10.4万人。蒋介石对美国人说，“过去不惜任何牺牲以坚守坚固据点或主要城市的老战略必须改变”。济南战役以前，美国舆论界说，“共产党的军事力量尚未达到夺取国民党任何一个防守较强的城市中心的程度”。现在，他们说：“自今而后，共产党要到何处，就到何处，要攻何城，就攻何城，再没有什么阻挡了。”

直至1948年10月19日，弹尽粮绝、突围无望的长春守军才被迫投诚。至此，孤城长春在重重包围下坚守了7个月。

最能让毛泽东下决心首选粟裕的原因，还在于林粟二人分别在辽沈战役和淮海战役决战中的表现。