10世纪时,中亚有三支突厥力量:定居于天山的回纥突厥,定居于喀什噶尔的葛逻禄突厥,以及定居于呼罗珊、里海、马鲁的乌古斯突厥。
公元956年,阿拉伯人在中西亚的势力已经四分五裂。在塞尔柱的统率下,一部分乌古斯人由咸海东部南下,进入阿拉伯藩国内,定居于咸海南部的花剌子模,这支突厥人信奉的是逊尼派伊斯兰教。
塞尔柱的后人于1040年攻入呼罗珊,成为古波斯核心地区的控制者。1043年继续西进,并吞米迪亚,陷两河上游东面的雷伊、哈马丹。1051年,攻占伊斯法罕,并迁都于此。此时,阿拉伯的阿拔斯王朝已经被挤压到两河流域的一小块地区。
1055年,应阿拔斯王朝哈里发之请,塞尔柱之孙图格鲁勒领兵进入巴格达,废黜在这里占据了110年的布韦希王朝末代王,成为阿拔斯王朝之摄政王——哈里发仅是象征性的宗教领袖。
图格鲁勒及其继任者阿尔斯兰、马里克三位在位时期,是塞尔柱乌古斯突厥人统治穆斯林东方的最灿烂的时代。这支野蛮的突厥势力屡屡推倒曾经威风于中西亚的阿拉伯政权,然而他们在脚踩着教徒的同时,又信奉着被征服者的宗教,从而变成伊斯兰教的拥护者,这使得伊斯兰社会在政治上极黑暗的时期,于宗教方面却得到了辉煌的胜利。
1064年,塞尔柱后人占领拜占廷亚美尼亚省首府阿尼。1070年,阿尔斯兰率兵攻占阿勒颇,其势力扩张到耶路撒冷和大马士革,并从什叶派法蒂玛王朝手中收复了圣地麦加和麦地那。
1071年,阿尔斯兰在凡湖以北打败拜占廷军队,俘虏拜占廷皇帝,占领小亚细亚东部。大量塞尔柱人相继迁往小亚细亚,伊斯兰教在小亚细亚得以传播。11世纪末,塞尔柱人的版图,东起中亚并与中国接壤,西至叙利亚及小亚细亚,南达阿拉伯海,北至基辅罗斯边境,形成强大的军事封建帝国。
11世纪90年代,塞尔柱人发生内讧,一些伊斯兰教清真寺被破坏,但从海路来的朝圣者只要缴纳为数不多的税后仍可去圣城耶路撒冷。然而罗马教皇和教廷却借此煽动宗教对立情绪。同时,拜占廷帝国失去小亚细亚后,被塞尔柱帝国逼到欧洲东南隅的狭小地区。1091年,塞尔柱帝国兵临君士坦丁堡,皇帝阿历克塞一世向罗马教皇和神圣罗马帝国皇帝求援,著名的十字军东征由此爆发。
剽悍的塞尔柱王朝在1092年后陷入皇族内讧,各地军事力量割据称雄,帝国开始解体,分裂成多个王国。存续时间最长的是小亚细亚的罗姆苏丹国,西北与拜占廷为邻,两国结成同盟;东南则有十字军在叙利亚建立的基督教国家,以至与东方日益隔绝。但与意大利商人之间的贸易却很兴旺。
1243年,蒙古军入侵小亚细亚,罗姆苏丹国从此沦为蒙古人的藩属,于1308年灭亡。不过,原先依附于他们的一支西突厥人,却越过海峡,征服了塞尔柱帝国和阿拉伯帝国都没能打下来的君士坦丁堡,进而建立起一个跨三洲帝国——奥斯曼帝国。