那时，有好多公司投标。“他投的标比较低，高了怕竞争不过人家”(黄夫人丁玉隽回忆)。由于黄万里是留美博士，加上当时航空委员会主管此事的处长陈官禄对他也有了解，比较信任他，所以长城公司顺利中标。包到工程后，他就把挣的钱分给大家。这支工程队伍既支持了抗战，大家的日子也好过了一些。黄万里“下海”后，经济上对父亲、大哥也一直有所接济。

有关这段经历，张先仕也有明晰的回忆，他说：

当时我们包了三个工程。一个是简阳机场，（是）小机场，由杨子英负责。第二个是在成都南门外，给美国空军盖了些草房，任宜勇负责。另外还修了一条四川省的公路，从新津到大邑的王场，叫王新公路，有二十几公里。修简阳机场时，我们发现原设计不合理，要浪费很多材料和劳力，建议修改。陈官禄很相信黄万里，接受了我们的建议，修改了设计。结果，既达到设计要求，又给国家省了不少钱。陈很高兴，就把省下来的钱拿出一些来，给我们提高了工程价格。我们也赚了钱。

修成都那个美国空军基地的营房也有个故事。当时好多栋房子刚修完，交了工，但一阵大风就吹倒了一栋。问题在哪里呢?我们把图纸拿来仔细一看，发现原来是美方设计错了。原设计没考虑到风力那么大。我们找到错误，黄万里就向发包方中国空军驻成都办事处交涉，提出事故是因为图纸不合理所致，应由甲方赔偿我们的损失。最后，我们打赢了官司，美方把那个美国工程师遣送回国了。美方承认错误，给了我们承包费用，我们重新又盖了一栋。这个工程搞了一年多。后来我们三个(杨子英、任宜勇和张先仕)离开黄万里，另成立蜀渝公司。我们修了从成都到双流的公路。我们还修了万县杨坪机场，美国空军B-29轰炸机从那里起飞，轰炸日本本土。机场工程一直修到八一五日本投降。几个月后，我到湖南修桥，对长城公司后来的具体情况就不了解了。但黄万里他们继续干，一直到1945年。黄万里这个人正派、公正，待人以诚，大家乐意跟着他。

黄万里领导的长城公司在张先仕等人离开后，继续投标修建美国空军使用的机场设施，1945年还投标修建汉中机场的营房。这是由美军第十四航空队的下属作战单位312飞行联队使用的。1944年11月柳州失陷后，美空军调整作战方略，这个联队驻防西安、安康、汉中机场，负责打击侵华日军补给线的北中段，1945年1月后，多次空袭中国华北日军的空军中心，给北平、济南、青岛、徐州等地日军空军基地以沉重的打击，破坏了日军的后勤补给线。黄万里就是在汉中美驻华空军基地施工时，得知抗日战争胜利的消息的。当时黄夫人带几个孩子去汉中，听到胜利喜讯，高兴得很。黄夫人说：“长城公司合伙人迅速把所有的余款分掉，大家各奔前程。黄万里叫我带着孩子和他分到的钱，与几个工程人员一同先回成都。途中绵阳发大水，过不了江，在绵阳涪江边被耽搁了一星期。”

抗战胜利了，大家得以重操旧业，建设国家。黄万里到重庆去工作，在全国善后救济总署任技正。黄万里家不远是有名的巴蜀中学，离父亲黄炎培住的张家花园不远。1946年春，黄万里回到南京任水利部视察工程师。