尤其我发现很多干部出现官僚主义，这些官僚主义具体的例子很多。我早上还讲到另外的例子，我们约了人在楼下应聘，对方坐了40分钟、50分钟，过了一个小时，我们的人迟迟不来见面。我们有一点傲慢，我们把自己看得太高了。记住我们是一家年轻的公司，我们都是年轻人。有一位政府官员到公司来，他在楼下接待室里面足足坐了五十几分钟才见到我们一个干部，他为杭州有这么一家公司感到骄傲，但是这家公司如果这么傲慢，这么不重视别人、不尊重别人，这家公司也会出问题的。

我觉得这些问题出在干部身上，也很可能是出在我身上，但是我们绝大部分的干部要承担职责。员工没有错的，错往往出在干部身上，干部的错出在公司总裁身上。我对自己去年的工作是不满意的，我已经跟董事会提出我2006年所有的奖金为零。我干得最辛苦，但是没有干好，我们只为结果付报酬。

——摘自2007年2月7日马云在集团年会上的讲话

2006年年底，阿里巴巴集团进行了有史以来最大一次的组织架构变动，阿里巴巴变成了一家控股公司，下面是5家全资子公司：阿里巴巴、淘宝、支付宝、雅虎中国和阿里软件。

马云的目的是希望在每个领域里面，5家公司都成为行业的领袖，成为行业的领导者，能改变行业的很多观点。

马云必须直面阿里巴巴的挑战，那就是“阿里系”规模变大、战线变长之后，对公司高管的领导力、管理力的巨大挑战。

“我们的组织进行了改造，现在是5家公司。从某种程度上来讲，作为多元化经营的公司，最大的挑战就是管理不够、组织体系不完善。阿里巴巴是同心多元化，我们使用互联网工具，但是我们把5家公司打造成一条产业链。我们的战线有点长，但是不得不长，为了这个行业、为了这个产业、为了这个国家、为了全世界的电子商务，我们不得不做这些工作。”