1947年11月，民盟被迫宣布解散后，马叙伦亦受到国民党特务的严密监视。但他坦然面对这一切，表示：“叙伦立身，本末不移，贫富威武，无动于衷，达观早成，生死一致。自今以拥疾之躬，待命陋巷之内，捕杀不辞，驱胁无畏，穷以私剑，投诸浊流，皆系于政府，于伦无与焉。”但中共对马叙伦等人的安全十分关心，于12月间相继安排马叙伦、王绍鳌、许广平等人秘密乘船离开上海前往香港。

1948年4月30日，中共“五一口号”发布后，马叙伦代表民进率先起来热烈响应，并积极参加了在香港开展的“新政协运动”。随后，马叙伦应中共之邀，与郭沫若等人一起踏上了北上解放区的旅途。