眼下最要紧的事情，就是定下来新皇帝的年号。载垣等人已经选定“祺祥”作为年号，太后读过不少书，知道这两个字意思不好，并且想让人永远忘记载垣等人犯上作乱的事情，于是用“同治”两个字作为新年号，主要是为了平息叛乱的想法，求得国家的稳定。如果从皇帝的角度出发，不管用什么年号，都没什么关系，这通过一些事情就可以看出来。更改年号的命令下达之后，当天两位太后又下达一道命令，说明自己掌握权力的原因，命令中的语气，是为了求得天下百姓的谅解，其大致意思如下：

奉两宫皇太后懿旨，垂帘听政，本非初衷，只以皇帝冲龄践阼，臣下不能无所禀承，故不得不俯顺群情。暂权国事，俟皇帝典学有成即当归政。凡我大小臣工务宜矢忠矢勤，共襄治理。其将此通谕中外知之云云。

随后又以皇帝的名义下达一道命令，感谢两位太后的热忱，当皇帝亲政之后，一定要勤奋小心地处理政事，以报答太后的恩典。两位太后在偏殿召见列位大臣，除了必要的大型典礼，皇帝、亲王以及咸丰同辈的四人都免去了磕头的大礼。经研究后，给予两位太后尊贵的称号，每个字每年都由宫中财政系统拨出白银十万两，作为两位太后的花销。给予东宫太后“慈安”的尊号，给予西宫太后“慈禧”的尊号，以后只要是大的典礼，就在太后的尊号上增加两个字。如慈禧太后70岁大寿之时，她的尊号已经有十六个字了。光绪皇帝还想再加上四个字，慈禧太后没有接受。慈安太后的尊号共有十个字。两位太后在30岁生日时候，都加上了两个字，同治皇帝登基的时候又都加上了两个字，同治皇帝丧礼之前，为了表述太后的功绩，又加上了两个字，慈禧40岁时候加上两个字，50岁时候又加上两个字。光绪皇帝婚礼时候又加上了两个字，慈禧60岁生日时候又加上两个字，一共有十六个字，那就是“慈禧端佑康颐昭豫庄诚寿恭钦献崇熙皇太后”这十六个字。