康熙帝晚年，发生废太子事件。在这场政治风暴中，允祉的命运如何呢？康熙四十七年（1708年），康熙帝废太子，因允祉与太子比较亲睦，召问太子情状。这时流言要加罪于允祉，康熙帝说：“允祉与允礽虽昵，然未怂恿其为恶，而且屡次劝止允礽，允礽不听。此等情节，朕无不悉知，故不罪也。”蒙古喇嘛巴汉格隆为允禔“厌胜”废太子，允祉知道后及时奏报。这说明允祉为人厚道，明辨是非，没有对废太子落井下石。康熙帝废太子后，害了一场大病。这时诸臣等多用虚语空文，惟允祉、胤禛对皇父真诚关爱，痛哭陈请，延医求药，使“朕之剧疾，业已全愈”。随之，允祉、胤禛、允祺，俱封为亲王。允祉在关键时刻表现得当，他本来跟允礽关系密切，不仅没因废太子事件受到牵连，而且还得到皇父的信任和恩赐。

允祉曾遭人陷害，皇父明察，侥幸脱身，这就是孟光祖事件。

孟光祖事件康熙五十六年（1717年）二月，镶蓝旗光棍孟光祖，称自己受诚亲王允祉差遣，到山西、陕西、四川、湖广、广西、江西诸省诈骗。四川巡抚年羹尧受骗，向他馈送马匹、银两，江西巡抚佟国勷（r　n　，又音xi　n　）也馈送过银两、缎疋。时有总督直隶兼巡抚赵弘燮奏报，查实，将孟光祖处斩。“佟国勷著革职，年羹尧著从宽革职留任效力。”此事，康熙帝下旨：“行文各省，通行晓谕。”但对允祉，并未怪罪。