到1826年，张格尔第三次入境，这次他成功地把当地回民煽动起来，呼地一下就掀起了大规模叛乱。1826年8月，张格尔攻破喀什噶尔（今喀什），参赞大臣庆祥兵败自杀，随后南疆四城全部陷落。西北边陲由此一片混乱，形势之严峻，让人恍然又回到了“大小和卓叛乱”的那个年代。

道光肩上所要承受的重量，不比当年的乾隆轻多少。

在张格尔叛乱中，裹从的“白帽回子”（即回民）超过数万，这让道光感到十分不解。因为自祖父平定“大小和卓叛乱”后，政府在那里实施的一直是轻徭薄赋政策，真是没向当地人收什么税，征多少役，新疆回部也“久已习为恭顺”，渐渐地服从中央政府了，怎么他们又突然会被张格尔所利用呢？

道光敏锐地感到这里面定有蹊跷，随即下令内阁首席、文华殿大学士长龄负责查访。长龄经过调查，确认原喀什噶尔参赞大臣斌静贪横不法，民愤极大，是导致张格尔乘隙作乱的间接诱因。斌静随即被革职拿问，由刑部按照“激变良民”律处以斩监候，后又交宗人府“永远圈禁”，这就是震惊朝野的“斌静案”。

道光宣布，对叛乱分子区别对待，胁从者如果能解甲归降，就予以赦免，各归各家，只对一条道走到黑的予以严惩，这就等于最大限度地孤立了张格尔。在道光组建的平叛班子中，长龄有统率之才，遂授以扬威将军。帅之外还要配将，将的人选是陕甘总督杨遇春，授以参赞大臣之职，作为长龄身边的左膀右臂。

此次征讨，道光从吉林、黑龙江、四川三省调集兵力达五万之众，为平定“大小和卓叛乱”时兵力的两倍多，但他仍无必胜把握。

与大小和卓时期不同，张格尔的叛军属于中外混合部队，除当地的一部分死硬分子外，还包括相当数量的浩罕（今乌兹别克斯坦境内）士兵，他们骑着马，挥着刀，嗜血好杀，彪悍善战，非常难以对付。

在大军出发之前，道光特地把出征将帅召集到一起，指着地图交代自己的作战方略。

“看见这个地方没有，此地名叫阿克苏，乃南疆之要冲，你们的先头部队到达这里后，不要急于冒进，以防中计。”