1938年4月上旬的一天，周恩来把李克农叫到办公室，交给他一个重要的任务，去武汉火车站迎接一位神秘人物。执行任务时，他才知道这个神秘人物原来是张国焘。周恩来告诉他，一定要在武汉截住张国焘，然后做工作说服他，希望他留在党内，不要做出叛党的事来。

从西安开来的火车停在武汉，李克农等三人上了车。三双锐利的目光，沿着车厢挨个搜索。终于，在靠后的一节车厢里，找到了张国焘。张国焘斜躺在座位上，歪着脑袋，一副无精打采的样子。他的警卫员张海已被特务缴了手枪，坐在对面。两边紧贴着两个国民党便衣特务，像是在等人来接应。

李克农带着张国焘下车，张国焘死活不肯住到八路军办事处。李克农一边派人向周恩来报告，一边悄悄地让张海将张国焘的行李（担心里面装有中央重要机密文件）搬到了“八办”，目的是防止张国焘向国民党泄露中共机密。

在武汉期间，为争取国民党杰出译电专家杨肆，李克农做了大量工作。杨肆供职于国民党交通部电政司密码检译所，这个单位实际上是专门负责监听日本电讯往来的情报机构。李克农通过杨肆的堂弟、共产党员杨述的关系，和杨肆见了面。杨肆还把另一位密码专家王维钧也一起带来了，李克农与他们很快谈得很好。杨肆、王维钧等人与中共接上关系后，将密码所破译的情报源源不断提供给中共方面，为中共方面的抗日做出了重要贡献。

军统特务头子戴笠想方设法挖杨肆，杨肆不愿去。李克农找他谈话，说服他到了军统工作。以后他每隔一星期就把军统破译的情报交给重庆地下党。1940年杨肆加入中国共产党后，中共方面为了保护他，指令八路军重庆办事处主任周怡与他单线联系。杨肆在抗战中破获了日本海军太平洋舰队的十二种密电码，日本关东军的十七种密电码等重要密码，受到嘉奖，1943年被国民党破格提拔为特种技术研究室主任，授少将军衔。这是后话。

1938年10月25日武汉大撤退前，周恩来前往衡山途中，碰上白崇禧的车抛锚，日军骑兵离他们已不远，周恩来让白崇禧上了自己的车，一起离开危险区。在车上，周恩来提出要在桂林设立八路军办事处，白崇禧同意了，但要求共产党方面不在广西挖桂系的墙脚，即不要广西地方上和军队中发展共产党。周恩来承诺能做到这一点，白崇禧为此派自己的机要秘书谢和赓回桂林，与桂系第三号人物、广西省长黄旭初打招呼。要求黄旭初对八路军办事处以礼相待，保证办事处人员的安全。