根据安全会议的建议，普京总统于2013年9月27日向国家杜马（议会下院）提出新法案，责成武装分子家属弥补对国家造成的损失，加强对恐怖分子的惩治。

一、犯罪分子实施恐怖行动后，家属和近亲有责任支付补偿金。

二、如怀疑家庭财产的来源涉嫌恐怖行动，恐怖分子家庭收入的来源就应接受检查。

三、补偿金和没收的家庭资产，用于抵偿恐怖行动给国家和居民造成的损失。追缴资产的期限等同于追究恐怖行动刑事责任的期限。

四、对恐怖团伙组织者处以10年-15年徒刑并处100万卢布（33卢布合1美元）以下的罚金；团伙或恐怖训练参加者，处以5年-10年徒刑并处50万卢布以下罚金。

五、在国外参加外国恐怖组织的恐怖分子，处以2年徒刑。

在安全会议成立初期，车臣反恐是头号课题。

位于北高加索地区的车臣共和国，在苏联解体后就开始闹武装独立。1994年12月11日，俄罗斯政府军进入车臣，开展反恐反分裂战役，这是所谓的“第一次车臣战争”。

由于当时的联邦政府软弱，这场正义的平叛行动举步维艰，半途而废。联邦政府于1996年8月31日同车臣非法政权头目马斯哈多夫签订了哈萨维尤尔特“和平协定”，联邦军人灰溜溜地撤出车臣全境。此后，车臣恐怖分子气焰嚣张，到莫斯科等大城市制造多起爆炸事件。

普京于1999年8月9日出任联邦总理，9月即兵发车臣，平定叛乱，这就是“第二次车臣战争”。普京目标明确，决策果断，俄罗斯政府军当年就取得击溃叛军、恢复联邦政权对车臣控制的战果。

从2003年起的7年间，俄罗斯在车臣所在的南部联邦区共击毙非法武装分子2000人，抓获6300人。从2003年到2008年的5年间，俄罗斯境内恐怖活动的数量锐减90％以上，其中2003年有551起恐怖袭击，2005年减为250起，2006年又减为130起，2008年更减为40起。2010年4月16日俄罗斯总统宣布，车臣结束反恐战争状态。

然而，就在这一年，俄罗斯就遭遇恶性恐怖事件：莫斯科发生地铁爆炸案、弗拉季高加索发生恐怖袭击案、莫斯科多莫杰多沃机场出口发生死伤数十人的人弹爆炸案。这说明，结束反恐战争状态并不意味着俄罗斯反恐事业大功告成。