虽然他与恺撒一直保持着交流，但是双方在政治上的立场始终无法统一。

恺撒遇害后，西塞罗为了恢复共和政体而对其进行了非常强烈的批判，结果却招致了马克·安东尼的怨恨。最终，他被作为元老院派的头目而走上了惨遭清洗的绝路。

得知搜查队逼近后，西塞罗从容应对死亡。他并未做出任何反抗，面对奴隶们自发成立的保护组织，他也只说：“勿行无用之事。”

搜查队奉安东尼之命，不仅割下西塞罗首级，还砍下他的右手一并带回罗马广场示众。显然安东尼对于西塞罗曾经撰写《腓力比克之辩》一事无法释怀。

从无比欢欣地看着恺撒遇害，到西塞罗自己举身赴黄泉，不过1年又9个月。公元前43年12月7日，西塞罗被杀，终年63岁。

恺撒死后，奥古斯都实现了他的理想，而西塞罗死后只留下了许多著作。也正是通过他的这些作品和书简，那个时代的气息与恺撒的伟大才得以流传后世。