根据摩尼长达12年的腹稿构思，摩尼教的教义概说（创世神话）是这样的：

宇宙鸿蒙之初，天地间存在光明和黑暗两种状态，光明之界在上方（东西北三向），主神是明尊；而黑暗之界在下方（南向），大魔头是暗界之王。暗界之王垂涎光明界的美妙，发动了侵略战争。为了抵御敌人，明尊率领明界神祇奋起反抗，拉开了轰轰烈烈的三次神魔反击战。

魔王第一次入侵时，明尊召唤出“善母”，她是一切生命的母亲，善母召唤出她的儿子“先意”，“先意”又召唤出他的五个儿子：气、风、光、水、火，即光明五要素（五明子）。

先意、五明子和群魔战斗在一起，但不幸寡不敌众，明尊遂发动了第二次反击战。这一次，他召唤出“明友”帮忙，明友召出“大般”，大般又召唤出“净风”，净风也有五个儿子：相、心、念、思、意，即五妙身。

净风击败了黑暗势力，救回了先意，但群魔并未荡尽，明尊遂发动了对暗界之王的最后一战！

他召唤出“第三使”（男性）和“电光佛”（女性），这两人以裸体的帅哥美女形象出现，促使黑暗群魔排出体液力尽而亡。群魔的尸体下坠后交互叠加，形成了大地，而群魔的体液落在地上、海里，变成了各种各样的飞禽走兽、花鸟鱼虫，其中有一男一女两个人类的始祖，男名亚当，女号夏娃，形貌颇似第三使和电光佛。

亚当和夏娃结合后，生下的子女就是人类。由于人类是光明和黑暗混合的产物，因此光明部分就成了人的灵魂，而黑暗部分则成了人的种种欲望，故而消灭欲望拯救灵魂成了摩尼教一项长期而艰巨的工作。

不难看出，摩尼教融合了基督教、诺提斯教、祆教以及佛教等诸多宗教文化因素，提出了自己的“二宗三际论”主张，即光明和黑暗构成摩尼教的“二宗”，两者永远对立。而“三际”者，指的是三个时段：初际、中际、后际，是二宗在过去、现在、未来三个时期的不同表现。

摩尼的二宗三际论和创世神话浅显易懂，经过30年的传经布道，很快就吸引了一大批信徒，影响力遍布波斯国及周边小国。波斯当时正处于萨珊王朝，三代君主阿尔达希尔、沙普尔、霍尔米兹德都成为了摩尼的“粉丝”，摩尼教大有取代祆教成为波斯国教的倾向。然而，摩尼的好运气到此为止，第四代国王巴拉姆一世反感摩尼教，处死了摩尼，禁止国民信仰摩尼教，摩尼教迎来了第一次生存危机。

摩尼死后，广大教徒为了躲避政治迫害，四散向周边国家逃亡，有的向北逃向中亚，有的向西逃向地中海，有的向南逃向了北非，有的向东逃向中国的西域邻国。虽然摩尼教徒们基本不受列国国王的欢迎，但无可辩驳的事实是，摩尼的忠实信徒们把摩尼教扩散到亚、非、欧三大洲，为摩尼教日后成为世界性的宗教打下了基础。