独立检察官肯尼斯·斯塔尔一收到琳达·特里普提交的录音带，便将他已进行了三年半之久的调查扩大到克林顿与莱温斯基的关系上。斯塔尔强调，他所关注的并不是克林顿的个人道德问题，而是他是否犯有作伪证罪，因为他否认与莱温斯基有过性接触。斯塔尔办公室调查询问了克林顿的近身助手和他的私人秘书，甚至还包括他的贴身秘密保镖，严重压缩了保护总统的机密范围。1998年8月初，莱温斯基作伪证否认与克林顿有关系一事得到司法豁免保证，换取了她在一个大陪审团前证实自己与克林顿的交往。

8月17日，轮到克林顿出面作证。在当天晚些时候通过电视向全国播放、事先录制的一盘作证录像带里，克林顿承认了与莱温斯基的关系，承认自己“严重有失检点”，承认自己与莱温斯基的关系184“不适当”，承认自己为了掩饰丑行而“误导了公众，也误导了妻子”。

9月9日，斯塔尔向国会提交报告，提出了可以弹劾克林顿的11项理由。尽管参议院的力量对比使克林顿最终被定罪的可能性微乎其微，但控制众议院的共和党保守派一意孤行，毫不退缩。12月19日，在一次严重党派化的听证会之后，众议院以泾渭分明的政党界线投票通过了两项弹劾条款，指控克林顿犯有作伪证罪和妨碍司法罪。

不过，美国经济一派繁荣，国会民主党人也紧密团结在克林顿周围。克林顿继续恪尽职守，行使总统权力，有时还取得了引人注目的效果。在1998年拨款谈判的最后阶段，克林顿威胁再次暂时关闭联邦政府，迫使作为国会多数党的共和党接受了他提出的大量立法计划，这一招使他深讨民主党人的喜欢。在以色列代表和巴勒斯坦代表之间马拉松式的和平谈判中，克林顿亲自在双方通宵达旦的讨价还价会议上进行斡旋，最终达成了一个突破性的和平协定，这个角色也为他赢得了赞誉。

如果说存在什么得不偿失的赢局，那就是共和党在弹劾克林顿案中所取得的成绩。在众议院通过弹劾条款之后的第一份民意调查中，克林顿工作表现的公众支持率飙升至73%，为其任期内的最高峰值。彼时，国会中期选举陆续揭晓，结果出人意料。参议院的两党力量对比维持不变，但民主党在众议院增加了5个席位——此乃1934年以来第一次出现控制白宫的党派在国会获得席位增长的情况。众议院的共和党人纷纷把矛头指向金里奇，金里奇被迫宣布将辞去议长一职，并辞去众议员职务。

1999年1月7日至2月12日期间，全国人民都在关注美国最高法院首席大法官在参议院主持的审讯会，听取众议院共和党人对克林顿的弹劾案。结果，两项弹劾条款都没有获得参议院多数票支持，离将总统赶下台的三分之二多数差得更远。