为了应付日伪“扫荡”，粟裕成立后方勤务部。后方勤务部长由罗湘涛兼任，所辖军工部、供给部、后勤部、兵站、卫生部、海上炮兵部队（一师有一门75毫米山炮，因转移不便，所以将那门山炮装在船上。粟裕在他《苏中海上游击部队的情况》电文中霸气地称之为“海上炮兵部队”）全部安置在海船上，对外称“渔民自卫队”。一旦日伪来袭，后方勤务部就向海上转移。

几乎在军工部成立的同时，粟裕着手对抗日军政大学苏中大队进行改造，将校址设在海复镇“通师侨校”。为了高质量地且卓有成效地为部队和地方培养优秀干部，粟裕为抗大九分校搭建了一个强大的领导班子。粟裕本人亲自担任校长兼政委，又从区党委和师政治部选调一批能力强的干部担任领导工作。副校长由刘季平担任，教育长由张日清（后杜屏）担任，政治部主任谢云晖（后张崇文）担任。

这个领导班子成员中的大部分在当时属高学历，阵容十分强大。刘季平出自江苏省立第二师范学校，谢云晖出自北京大学，张崇文出自上海大学。其他领导成员姚耐、鲍汉青、杨芝均有留学日本的经历。

抗大九分校教师队伍中还有一位日籍人士。这人叫冈本进，是粟裕在芜湖附近伏击日军时抓的俘虏，后参加反战同盟。他在九分校教日语、刺杀和武器知识。

同时，苏中军区党政领导叶飞、钟期光、管文蔚，四分区地方领导季方、梁灵光等人都参与抗大九分校的建设。他们亲临学校指导，有的还直接承担教学工作。

学校设军事队、政治队、参谋训练队、青年学生队、地方武装队、电台训练队、会计培训队等7个队，另附设1个医务干部训练队，全校教职员共600多人。

粟裕对办学方针和教育措施做出指导，强调九分校的教育教学要从实践需要出发，从学员的具体情况出发。

粟裕那时很忙，但经常去学校听课。有一次他听课时发现某教师讲战术课时照本宣科，讲得太宽太空，课后便找这位教员交谈，指出讲课一定要分清团营干部和连排干部不同对象，不能照搬教材，要有所取舍，使学员听得懂，用得上，求精、求实、实用。

在粟裕的重视下，九分校对教育方式和内容进行改革，在教育教学中根据不同的对象有所侧重。对有实战经验的学员，学校就帮助他们提高理论水平，特别侧重近战、夜战的教学。在教学方法上，野外演练多于课堂讲授，研究战例、总结实战经验等。对文化水平偏低的学员，九分校便用50％甚至80％的时间对他们进行文化教育。除教语文识字外，还教算术、历史、地理、自然常识等课程。这使学员们得以掌握了初步的文化知识，从而获得了学习军事政治和专业知识的钥匙。

经过一段时间的筹备，抗日军政大学苏中大队于5月份正式改称抗日军政大学第九分校，简称“抗大九分校”。