陈诚不可能失宠于蒋介石。

在重庆休养了半年，陈诚的胃病基本康复，他被蒋介石派往战地。1944年4月，日军发起豫中战役。5月，陈诚奉命飞往西安，协助作战。6月，豫战失利，潼关告急，他又任第一战区司令长官。7月，飞汉中设立长官部，调整部署，补充训练并监督陕豫党政机关。8月，往西安指挥潼关方面军事，阻敌西侵，以挽西北之局……

这一年，在太平洋战争中节节败退的日军回光归照，在中国发动了豫湘桂战役，由北向南，几乎势如破竹，而国民政府军队兵败如山倒。当年秋天，日军打到了柳州，12月，终于打通了从华北到华南以至印支的通道……

国民政府军队的战场失利，为陈诚铺平了通向权利高峰的道路。1944年11月，陈诚接替何应钦，登上了军政部长的宝座。

这次升迁非同寻常。1938年初至1940年秋，陈诚担任军事委员会政治部长，而且权利也不小，但这毕竟是政工职务，不是他的军事“专业”。他梦寐以求的是何应钦的军政部长一职。

陈诚与何应钦不和，历来已久。即便在公开出版的回忆里，陈诚也毫不掩饰对何应钦的不满：“说老实话，敬之先生本人公忠体国，吾无间然，不过他主持军政部时间太久，不免受人包围，以至遭受许多物议，实在可惜。”

早在1927年，何应钦参与对蒋介石的“逼宫”，招致蒋的不满，蒋一复职就剥夺了他的兵权。1936年西安事变，何应钦力主轰炸西安，出兵征讨张、杨，更使蒋猜疑何的居心。何差一点又被打入冷宫，只是因为抗战的需要，才勉强留在军政部长的位置。

何应钦从1930年开始担任军政部长，1938年任军事委员会参谋长，仍兼任军政部长。何本人做事競競业业，并无太多可以指责，但他的下属机构，特别是后勤机关的贪污走私之风相当严重，他也因此遭到国民党内外的猛烈攻击。美国军事顾问对他更是不满，要求蒋撤换其军政部长一职。正好，中国战区需要配置一个陆军总司令的虚职，蒋有意让何腾出军政部长一职，推荐继任人眩何应钦明知蒋心目中的人选是陈诚，但他还是推荐亲信顾祝同、刘峙。蒋搁置不批，何去催问，蒋问：“辞修如何？”何再也不敢装糊涂了，只好改荐陈诚。

1944年11月21日，国民党中常会及国防最高委员会作出决定，任命宋子文为代理行政院长，陈诚为军政部长。此时，史迪威因与蒋介石意见不合，被罗斯福召回，其中国战区参谋长的职务由魏德迈继任。

蒋不同意顾祝同或刘峙而是让陈诚出任军政部长，原因很简单，陈诚比他们更忠诚，也更能卖命。当时流传一个政治笑话：“蒋为考查何应钦、陈诚等人对他忠诚的程度，—日急召集何、陈等几个亲信人物到其住处议事。众人坐定后，蒋突命诸人去死。此时何应钦坐着不动，对蒋的话不予理睬；顾祝同指出许多不能去死的理由，刘峙则苦苦向蒋哀求免死；而陈诚呢？只见他向蒋一个立正敬礼后，即转身向门外走去……”。这个笑话虽然有点荒唐，但也很能说明一些问题。

次年1月9日，国民政府行政院决定，将后方勤务部改组为后勤总司令部，隶属军政部，由陈诚兼任总司令。原兵役署署长、劣迹斑斑的程泽润被免职，不久即被蒋介石亲自下令枪毙。

陈诚上任后着手做了两件“大事”，一是充实部队军力，一是改善官兵生活。当时，国民政府军队表面上兵多将广，实际上一个军虽有3万个名额，却只有2000支步枪作战，而且薪饷菲薄，给养低劣，部队长官又吃空缺，以至士气低落。因此，魏德迈建议，裁撤机构，裁撤冗员，把全国军队生活和战斗力提高到与远征军一样的标准。

补充军力，主要是装备美械；改善生活，主要是加薪。这两项都牵涉到裁员。新的薪金标准在1945年2月就制定出来了：少将由8000元增加到16000元；少校由4400元增加到10000元；少尉由1650元增加到5000元；下士由180元增加到450元；二等兵由90元增加到300元。