普京在莫斯科的快速崛起，很大程度上得益于他“反恐坚强斗士”的形象。

时任联邦安全局长、国家安全会议秘书的普京临危受命，接替斯捷帕申担任俄罗斯总理，此时，车臣匪徒在达吉斯坦和莫斯科、伏尔加顿斯克以及布伊纳克斯克等地制造了一系列恐怖事件，这使普京怒发冲冠，他从牙缝里挤出了一句话：“我们打击恐怖分子必须坚持到底，即使他们逃到厕所里，我们也要把他们溺死在马桶里！”

普京有了大显身手的条件。他毫不犹豫地承担起了再次发动车臣战争的责任，命令俄军重拳打击车臣叛匪。这一招果然奏效，俄罗斯公众舆论为之一变，普京的威望也因此不断攀升。普京没有辜负叶利钦的重托，用政绩证明了自己是一个有用之人。

1999年8月中旬，在国家杜马讨论是否正式任命普京为总理的会议上，普京就处理车臣问题再次发出了坚定的声音：“俄罗斯的领土完整不可能是讨论的问题，而且不可能是和每一个侵害领土完整者讲价钱或进行恐吓的问题。”普京出任总理后的第二天便发表讲话：政府将坚决彻底地打击车臣匪帮。接着，他亲自统帅联邦军队展开了对车臣恐怖分子的大规模围剿。

根据普京的部署，俄军出动飞机和远程大炮，对盘踞在达吉斯坦的非法武装进行了猛烈轰炸。8月18日，俄军完全控制了具有战略意义的哈拉米山口，切断了车臣匪徒进入达吉斯坦的通道。

1999年9月16日起，大规模围剿恐怖分子的军事行动的序幕拉开了。俄军已作好攻占车臣的一切准备。

9月23日，俄罗斯总统叶利钦签署命令，在北高加索实行反恐特别行动，第二次车臣战争随即打响。

10月1日，俄军装甲部队在炮火的掩护下，兵分三路，从达吉斯坦、印古什和斯塔夫罗波尔突入车臣境内，对车臣形成三面夹击。这是自1996年撤出车臣后，俄军首次进入这个北高加索共和国。

10月6日，俄罗斯内务部和国防部的机动部队彻底完成了在车臣边界建立安全区的任务。先后投入近10万兵力，包括宇航部队、精锐的空降部队和山地特种部队，诸兵种联合作战。联邦大军在车臣周围建立了隔离带。俄军动用苏-24战斗机、米-24武装直升飞机和激光制导炸弹等先进武器，向车臣非法武装占据的主要战略目标进行大规模、远距离、非接触性的打击，最大限度地消灭了非法武装的有生力量。

与第一次车臣战争相比，这次车臣战争更具有现代战争的特点，其战术得当是一方面，大量使用先进武器则是俄罗斯军队节节胜利的重要保障。此次俄军把凡是能使用的最新式的武器装备都投入到了车臣战场上。像卡-50、“黑鲨”、“真空炸弹”等一大批新式武器装备都得到了广泛运用。俄军似乎也从北约大规模空袭南联盟的军事行动中吸取了经验，在作战中大量使用高技术空袭兵器，各种米格、苏式战机不断将激光制导炸弹扔到恐怖分子的头上，既提高了作战效果，又减少了平民的伤亡。