就在太子李贤被废的第二天，也就是永隆元年（680年）八月乙丑日，英王李哲被立为皇太子（后来即位时李哲改名为李显），改调露年号为永隆，又一次大赦天下。

如此频繁地更换太子，在历代实在少有。高宗李治把这一切看在眼里，急在心上，但他又没有能力去改变什么，整日忧愁着度过，身体状况自然更糟。就在李贤被废之后，高宗的身体状况急转直下。

《资治通鉴》上关于李治的病情曾有过这样的记载：“（显庆五年）冬，十月，上初苦风眩头重，目不能视，百司奏事，上或使皇后决之。后性明敏，涉猎文史，处事皆称旨。由是始委以政事，权与人主侔矣。”从这里可以看出，皇后理政是由于高宗的病情太重，从而开始决断朝廷的一切事宜。另外，武则天天性聪敏，文史精通，处理起政事来也有条不紊，处理得也颇有分寸，事事按照高宗的意思顺旨而行，因此得到了高宗的信任。然而，武后一度“权与人主侔”仍是暂时性质，后来她之所以能长时间地掌握朝政，实为高宗不时发病且病势日益加重，自己乘机刻意发展的结果。

高宗自显庆五年风疾发作之后，病情一直不曾好转，同时似乎还染上了肺病，“久婴风瘵，疾与年侵。近者以来，忽焉大渐，翌日之瘳难冀，赐年之福罕邀。”风是指风疾，瘵多指痨病，也就是肺病。在中国古代，这种病几乎无药可治，人一旦患上，只能长期调养休息，经常服药。据史籍记载，高宗患病之后仍然十分勤于政事，朝堂上的大臣曾经上书劝谏他保重身体：“天皇昔常服饵，近更躬亲，睿情勤苦，天仪憔悴，若何以万能乘之重，四海之尊，暴露而行，旰日而食者也？”意思是皇帝您经常因病服药，现在因为整日忙于政务，更是憔悴，不应该再顶着酷暑长途跋涉劳累不堪。

后来，李治在久病不愈头疼难忍的情况下，不顾先帝太宗服丹毙命的前车之鉴，开始广征方士，炼丹合药。从开耀元年(681年)开始，李治也开始像前人一样服食丹药，当然，结果我们完全可以想象，并没有任何效果，他这风疾的病势反而变得更加沉重。

风疾似乎是李唐家族遗传病，根据史料记载，李唐家族有七位帝王曾先后患过此病，即高祖、太宗、高宗、顺宗、穆宗、文宗与宣宗。唐高祖是第一个得风疾而死的唐代帝王。据《资治通鉴》记载：“太上皇自去秋得风疾，庚子，崩于垂拱殿。”唐太宗李世民也有“得风疾，苦京师盛暑”的记载，不但如此，他还曾经把自己服食的药物赐给同样“以风疾废于家”的大臣高季辅。在李治之后的唐顺宗更是因为风疾而导致四肢瘫痪，口不能言，只能靠眼神和点头摇头来表示意见，“太子始得风疾，不能言”，导致继位后朝政为权臣王叔文所把持。到了穆宗，“因得风疾，不能履地，自是人不闻上起居”。文宗“上始得风疾，不能言。于是王守澄荐昭义行军司马郑注善医；上征注至京师，饮其药，颇有验，遂有宠。”这里讲到唐文宗因为得风疾而口不能言，郑注便是因为治疗有效而得到文宗的宠信，委以腹心，然而郑注才不能任，最后导致了甘露之变的惨剧。

武则天也明白李治的身体撑不了多久了，他毕竟是自己的丈夫，自己的心里其实还是爱着他的。那一段日子里，武则天在处理完平时的政事之后，尽量多陪着高宗。有的时候，他们也会聊到一些子孙的事情。