卢生游说始皇说:“寻找灵芝奇药以及神仙,老是找不到,这是因为物类会伤害他,所以方术合乎君王的时候,就必须隐微而行以躲避恶鬼,恶鬼躲避真人的来到。君上居住的地方,作臣子的知道了,会妨碍神露。所谓真人,沉没水底,也不会被水浸湿,进入火坑,也不会被火烫伤,驾着云气在天空里游行,寿命和天地一样长久。现在陛下您为了治理国家,生活无法安静清淡,希望您居住的宫殿不要让人知道,然后吃了不死的仙药才能找到。”于是始皇说:“我非常羡慕真人。”从此以后称呼自己为真人,不叫朕,因此下令咸阳附近二百里内,设立宫殿两百七十座,夹道、驰道互相连属,把帷帐、钟鼓、美女安置里面,各别记载所处的地方,不准迁移,他所临幸的人如果说出皇帝在那儿,判处死刑。有一次始皇临幸梁山宫,从山上望见丞相的坐车及随从卫队众多,很不高兴。太监把这事告诉丞相,丞相便减少车乘卫队,始皇生气地说:“一定是梁山宫的人泄漏了我的话。”审问泄漏的案件,没有人肯认罪,这个时候始皇下令逮捕他在宫时随侍在旁的人,把他们都杀了。从此以后再也没有人知道皇帝居留的地方了。办理国政以及群臣接受命令,都在咸阳宫进行。
侯生、卢生互相商议说:“始皇的为人,天生脾气刚强暴戾,自以为是,从诸侯出身到兼并天下,凡事称心如意任意而为,因此认为从古到今没有人胜过自己。专门任用治狱的官吏,治狱的官吏得到他的亲信宠爱。博士虽然有七十个,只不过充充人数罢了,从不曾采用。丞相以及大臣仅仅接受已经决定的命令,一切事情都倚靠皇帝办理。而皇帝喜欢用刑法杀戮来建立威严,天下人害怕触犯法网,惟有行尸走肉般小心谨慎地保存俸禄,没有一个敢竭尽忠诚。君上听不到自己的过失,一天比一天骄狂,臣心惊胆跳整天说些谎言欺骗他,以博取他的喜欢。秦的法律规定一个人不可以同时兼二种职业,考察出某人不精于自己的行业就处死,如此残酷,天都出现恶兆,而候望星象的有三百多人,个个技术精通,却畏惧始皇的忌讳,不敢正色说出他的过失。天下之事不论大小都由皇帝决定,文书多到用秤子量,而公文的往返又有一定期限,为了不超越期限忙得无法休息,贪婪权势到这种地步,这样的人不可以替他寻找成仙之药。”于是都逃走了。始皇听到二人逃走的消息非常愤怒,说道:“我前些时候没收天下的书籍,不合时用的都烧掉,招致许多文学方术之士,想要谋求国家的太平,这些方士企图炼丹求奇药。如今韩众一走再也不回来复命,徐福等人浪费庞大的钱财,还找不到不死的仙药,每天只是徒然说些营求奸利的无用之言。卢生等人我对他们很尊敬,赏赐极多,如今竟然诽谤我,加重我的不仁,居住在咸阳的一些儒生,我派人去察问,有些则专门制造妖言,迷惑百姓。”于是命令御史审问儒生,必须互相告发才能免去自己的罪,触犯法令的有四百六十多人,挖了土坑,把他们全部活活埋死,昭示天下,警告后人,又增派更多徒隶到边境上屯戍。始皇的大儿子扶苏劝谏道:“天下刚安定不久,远方百姓还未能招集,儒生们都是诵读效法孔子的,现在陛下用严厉的刑法来处置他们,我害怕天下将不安定了,希望陛下仔细考察。”始皇大发脾气,命令扶苏到北边的上郡去监督蒙恬。
三十六年,荧惑星乱了应有的行次,接近心宿三星,(《天官书集解》引孟康曰:居其宿曰守。)有一颗流星从东郡的上空落下,到了地面变成石头,有老百姓在上面写道:“始皇死亡,土地分割。”始皇听到这事,派遣御史逐家审问,没有人认罪,于是把居住在石旁的人通通抓起来杀了,然后用火烧掉这块石头。始皇闷闷不乐,就命令博士作《仙真人诗》,当他出游天下的时候,传令乐工演奏歌唱。秋天,使者从关东来,夜里经过华阴、平舒间的道路,有一个人拿着璧玉拦住他,说:“替我把这块玉送给滈池的水神。”(不取张晏说。)又说:“今年祖龙会死掉。”使者问他为什么,这个人却忽然不见,留下璧玉离开了。使者上呈璧玉,把以上的事一一告诉始皇,始皇默默无言,过了很久才说:“山里的鬼怪所知道的事,本来就不超过一年。”退朝以后说:“祖龙是人类之先、君之象,指的该是我吧!”命令御府查看这块玉,竟然是二十八年巡行天下时,渡长江祭江神所丢进水里的,因此使人卜问吉凶,卦象表示游徙活动才吉祥,便迁了三万户人家到北河、榆中定居,赐他们民爵一级。