美国的人民还在战场上流血牺牲。美国希望他们的士兵能重回美好的家园，他们试图回到和平所带来的舒适安稳和经济利益中去。所有这些愿望可能会让他们做出除了无条件投降之外的一些妥协，而这恰恰是日本所期望的，他们企图依靠美国人民对战争的厌倦而逃过一劫。

政治家、军事首脑和顶尖科学家开始会晤，讨论在何时何地向日本投放原子弹。

5 月31 日，他们举行了一次重要的会议，会议目的是估计原子弹对日本造成的破坏。奥本海默估计死亡人数在2 万左右。为了更清楚估算原子弹造成的毁坏，投放的目标将是还没有遭受轰炸的日本大城市。

在原子弹爆炸试验的准备工作即将完成之前，有人提议邀请日本人亲眼见证一下这种新型武器的可怕威力。奥本海默驳回了提议，一方面他担心试验失败；另一方面他怕试验成功，在正式投放前给日本一个警告的话，他们会把盟军战俘转移到原子弹投放地。

在5 月31 日召开的五角大楼会议上，美国通过了原子弹投放方案，美国将在不警告日本的情况下直接投放原子弹。6 月1 日，杜鲁门接受了委员会的建议。

1945 年7 月16 日清晨5 点30 分，科学家们聚集在新墨西哥州的聚尼堤实验点，目睹了世界上第一件核武器的威力。爆炸所释放的能量相当于两万吨TNT 炸药的总和。10 天后，杜鲁门、丘吉尔和斯大林在德国波茨坦会议上讨论了日本投降问题，并与其他盟国领导人商讨战后世界的问题。杜鲁门想在前苏联没有介入的情况下尽快结束战争，这样美国就可以主张分割远东地区的领土。原子弹使杜鲁门看到了美国单方面结束这场战争的希望。

在波茨坦的杜鲁门收到了这场试验结果的电报。他告诉斯大林，美国拥有一种威力巨大的新式武器。杜鲁门并不知道，前苏联情报部门早已获悉原子弹计划，只是无人知道原子弹的潜在威力。

盟军的欧洲最高司令官德怀特·艾森豪威尔将军反对投放原子弹，原因是日本已经被打败，海军参谋长莱易上将也持相同意见。尽管如此，杜鲁门衡量了问题的方方面面之后，还是做出了决定。

1945 年7 月24 日，杜鲁门总统正式通过了投放原子弹的重要决定。总统令是这样说的：只要天气适宜，509 军团的空军20 号将于8 月3 日左右投放第一颗特殊炸弹，目标是日本的下列城市之一：广岛、小仓城、新泻和长崎。