公元前44年，恺撒在罗马遇刺身亡。三年后，原恺撒的部将、罗马执政官安东尼（MarcusAntonus，前82～前30）在奇利奇亚召见克丽奥佩特拉，准备追究她对罗马的背叛行为。气势汹汹的安东尼跟女王交手不过两个回合，便拜倒在石榴裙下，彼此立刻爱得死去活来。公元前37年，他们终于在埃及宣布结婚。

此时的安东尼，对克丽奥佩特拉的痴迷已到了癫狂程度，竟然要把罗马在东方的部分领土奉送给他的埃及情人。罗马元老院立刻作出激烈反应：宣布出征在外的安东尼为“祖国的敌人”，并对克丽奥佩特拉宣战。

公元前31年，安东尼与克丽奥佩特拉率舰队与新任罗马统帅屋大维（Gaius Octavius）在亚克兴海角展开会战。战斗开始后，克丽奥佩特拉突然甩下安东尼逃回了埃及。安东尼见状竟掉头去追赶克丽奥佩特拉，从而输掉了这场战争。最后，这位曾经叱咤风云的前罗马统帅被迫自杀，死在克丽奥佩特拉的怀抱里。

当新的胜利者屋大维攻入埃及之后，三十九岁的克丽奥佩特拉又企图引诱这位安东尼的小舅子（安东尼在罗马的妻子是屋大维的姐姐屋大维娅），但没有成功。为了免于被拴在屋大维的战车后，作为俘虏押回罗马，克丽奥佩特拉的心腹使女将一条小毒蛇藏在一篮无花果中，送给了已被严密看管起来的克丽奥佩特拉。克丽奥佩特拉就让这条可爱的小毒蛇咬了一下自己的乳头，然后盛装端坐在她的御座上，面带微笑，安详地死去。

她死之后，埃及人怀着无限崇敬的心情，按照古埃及风俗将一头牡牛的阴茎——象征匹亚斯神的阴茎、也象征太阳繁育万物的灵根——塞入她的阴道，然后封闭起来入土安葬…… 看来在埃及本土克丽奥佩特拉的性生活没有遇到什么麻烦。她除了赢得埃及人普遍的尊崇外，更成为后世文人争相演绎的文学题材。也许有较多的人认为，克丽奥佩特拉的性行为包含有政治意图，这个看法自然有一定道理。但这不能当做历史对她的性行为持宽容态度的唯一原因。