威廉背弃植根于约翰·加尔文教义的苏格兰长老会，但是，这种行为在当时并非不同寻常。大多数激进分子都把教会视为反对1832年选举改革的托利党--英国国教当权派联盟的一部分。影响威廉的另一个因素是，加尔文教派的上帝既不仁慈，也不明智。该教派否认个人意志，不加区分地保佑或谴责人们。他不想让这种命定论教义妨碍子女们的成长。毫无疑问，玛格丽特对丈夫的选择感到高兴，因为她的娘家人早在数年前就已经采取了这种行动。她本人深受热情洋溢的威廉·埃勒里·钱宁的影响。这位美国牧师为亨利·戴维·梭罗撰写了一部传记，并努力传播上帝一位论（这一新教派别认为上帝是一个人，而非三位一体，并相信个人的道德力量）。16世纪60年代以来，上帝一位论教派就存在于特兰西瓦尼亚。19世纪初期，钱宁为传播这一教义做了大量工作。他指责加尔文教的上帝腐朽（思想激进的莫里森一家很赞同这种观点），却明确地把人类本性同堕落区别开来。他相信，男人和女人在自身精神的演变过程中共同遵循着一种神圣的模式；人类最主要的优点是能够"在智力和精神上同上帝保持亲密无间"。玛格丽特对此种主张深表赞同，也幻想自己的安卓能够拥有这种优点。他将不会服从加尔文教派那种荒唐的神性，而是要与上帝同行。尽管如此，她却从未参加任何上帝一位论教派的宗教仪式。作为一名苏格兰妇女，她从未摆脱植根于加尔文教的清教徒式的个性。

威廉对上帝一位论教派仍心存疑惑，于是选择加入一个规模很小的宗教团体：斯维登堡新教会。卡内基家族和莫里森家族的其他成员也相继加入其中。这一教派以瑞典科学家、见神论者和神秘主义的倡导者伊曼纽尔·斯维登堡的教义为基础。斯维登堡在度过一段研究数学和自然科学的平静生活之后，在1745年受到一次神秘启示。他在幻觉的基础之上提出了世界存在的3个领域：神意、精神世界和自然世界，而爱、智慧和习惯与之分别对应。在他看来，生命是同上帝共享的，神性等同于永恒的爱。现在看来，这个斯维登堡可能只是一个念叨见神论、幻想自己是先知的骗子，不过，他鼓吹的仁慈上帝却非常符合威廉心中的想像。实话说，威廉也有一点儿耽于幻想，时常因为对宗教的冥思而停下手中的织布机。邻居们有时把他称为"永不融化的小伙子"。由此可见，他确实有一点喜好幻想、不切实际。

这两个教派都认为人类不是生而堕落，没有任何人事先注定要得到拯救或遭受诅咒。无论怎样，威尔和玛格丽特从未像别人那样对宗教产生狂热。惟一给安卓留下很深印象的事情是：人们能够从任意一种宗教行为中获得信念，而这些信念必定会在以后的生活中昭示出来。卡内基家族否认苏格兰长老会在他们生活中的影响力，但是，加尔文教派在苏格兰的影响如此深远，其精神实际上已经渗入这个家族成员的灵魂深处。这种精神的内涵包括：严守道德、忠于家庭、节俭、勤奋、审慎。安卓曾经回忆，"对我而言，加尔文教派的苛刻教义有如一场噩梦"。后来，这场噩梦一点点淡去，却也未被安卓忘却，尤其是当他得到财富和名誉之后。这是因为，那时的他开始逐渐相信，自己是得到加尔文庇佑的众生之一，捍卫人类文明的神圣受托者。