鳌拜虽然气焰熏天，但进殿面君时，按制度也不能随带保镖，面对一大群有皇上撑腰的生龙活虎般的少年侍卫，只能束手被擒。李国荣：《康熙智擒奸相鳌拜》，载于《科技文萃》1994年第5期。具体的过程由当今影视剧一遍遍地渲染，现代人大概都耳熟能详了。

擒住鳌拜之后，康熙火速命令效忠自己的官员们将其党羽一网打尽，大臣会议审实鳌拜罪状30条，议将鳌拜革职，立斩，子侄兄弟一并斩首，眷属家产籍没。鳌拜请皇上察看他当年在搭救清太宗皇太极时，身上留下的刀疤箭伤。康熙帝念其历事太宗、世祖两朝，效力多年，屡建战功，不忍加诛，将死罪改为终身拘禁。将同党多人处斩，其余分别做撤职、降级处理。不久，鳌拜在幽所郁郁而终。

康熙除鳌拜一事，现在看来是典型的皇帝与权臣的斗争。它的戏剧性之处，或者说它令人着迷的地方，就在于这是一位年轻的皇帝用“年轻人的方式”解决的。鳌拜作为“天子自将之师”镶黄旗的重要将领，忠心事主，始终不渝，在皇太极去世后坚决拥立其子为皇位继承人，甚至不惜兵戎相见，最终争得福临即位。为此他与睿亲王多尔衮结下怨仇，在后者摄政期间，多次遭受残酷打击，三次论死。鳌拜作为清初一员骁将，其性格是耿直倔强、敢于抗争的。他对故主皇太极忠心耿耿，一片赤诚，对顺治也始终坚守臣节，称得上是一个难得的忠义之臣。但鳌拜的政治思想是落后的，在清朝入关后依然固执地坚持关外的落后制度，背社会、经济潮流而动。在后期他因擅权而被革职抄家、身死禁所，康熙至此才算做了真正的皇帝。