慕尼黑惨案发生后，以色列举国哀悼。9月7日下午，以色列为死难者举行了隆重的国葬，梅厄总理没有参加，她的姐姐刚刚去世。阿隆副总理代表总理致悼词：“这是与奥林匹克精神相违背的残酷行为，我们要战斗到底！”有人猜想，总理大概想避免在葬礼上遭人唾骂或石块的袭击。尽管没有理由将惨案归咎于她个人。与此同时，摩萨德首脑扎米尔受到了解内情的高级官员们批评，他们认为以色列情报机构实际已经得到了警示，此前不久，黑九月的恐怖分子曾在以色列利达机场向候机室的大批乘客扔手榴弹，并用自动冲锋枪扫射，致使百余人或死或伤。而以色列代表团开赴联邦德国之前，已经大量获悉黑九月将在奥运会期间展开行动的情报的摩萨德，却无法预知这些所谓的行动包括哪些。而作为主管，扎米尔显然大意了，他认为恐怖分子是不敢袭击以色列运动队的。尽管他曾提前一个月派了两名特工去联邦德国，仔细检查联邦德国安全机构保安计划。当联邦德国方面做出了严肃的保证后，两名特工就撤回了。而以色列代表团成员既没有武器，也没有任何准备来对付恐怖分子的袭击。最令人莫名其妙的是，代表运动队负责与当地保安机构联系的竟是一位随队医生。这些都使扎米尔难辞其咎。扎米尔也觉得冤枉，如果敌人存心要拼，那么这样的袭击无论什么样的防护措施都是不可避免的。但是不管扎米尔怎么解释，人们对摩萨德多少有了一些不信任感。总理梅厄夫人虽然安慰扎米尔，但她已任命其宠臣阿哈隆?亚里夫将军为“恐怖主义事务特别助理”，削去了扎米尔的一部分权力。

不过，黑九月造成的灾祸也给摩萨德带来了一个立竿见影的好处，一夜之间，它的预算几乎增加了一倍。利达机场和慕尼黑的残杀事件导致的直接后果是使情报机构得到以色列政府批准，允许他们使用“暗杀”这种极端的恐怖主义进行报复。