概不问，领土大小，军容赢诎。

文化同肩维护任，武装合组抵抗术，

把野心军阀尽排除，齐努力。

我中华，泱泱国，爱和平，御强敌。

两年来，博得同情洋溢。

独立宁辞经百战，众擎无愧参全责。

与友邦共奏凯歌曲，显成绩！

蔡元培寓居香港，化名周孑余。出处在于《诗经》大雅《云汉》："周余黎民，靡有孑遗。"周乃蔡之母姓，故喻母周之子。他在香港深居简出，绝少公开活动。唯一的一次公开活动是出席美术展。1938年5月20日，蔡元培应宋庆龄的邀请，出席由"保卫中国同盟"及"香港国防医药筹赈会"于圣约翰大礼堂举行的美术展览会，并公开发表演说，宣传"美术乃抗战时期之必需品"，"抗战时期所最需要的，是人人有宁静的头脑，又有坚毅的意志，……而鄙人以为推广美育，也是养成这种精神之一法"。

1940年蔡元培正积极准备入内地时，患了重感冒。3月3日清晨，蔡元培在寓所起床时，忽觉头晕目眩，失足仆地，随即口吐鲜血。家人急召医生诊治。由于时为星期天，商务印书馆特约西医朱惠康至中午始到，后玛丽医院内科主任凌医生应请前来会诊，疑为胃疾，建议住院治疗。翌日，由周夫人和朱医生侍伴，送蔡元培过海到跑马地香港养和医院救治。

在蔡元培入院前后，王云五都曾前往探望。4日晚9点，蔡元培胃出血。5日，原定继续输血，早晨8点钟，王云五接到医院通知蔡元培病情转危的电话，一面赶往医院，一面通知商务印书馆在职工中征求捐血者。急救不及，蔡元培先生于9时45分病逝，享年73岁。他的遗言中有"我们要以道德救国，学术救国"的话。除家属蔡夫人周养浩及内侄周新当时在场外，王云五成了蔡元培朋友中惟一随侍病榻的送终者。

蔡元培病逝后，吴铁城、王云五、许地山、叶恭绰、简又文、张一麟、陈彬和等组成治丧委员会，治丧处设在香港商务印书馆。3月7日，蔡元培的遗体在香港摩理臣山道福禄寿殡仪馆入殓。蔡元培一生清廉，身后无一点积蓄，衣衾棺木的费用，所欠1000多元的医药费，都是王云五代付的，以后子女的教育、抚养费，也都得到了先生好友、学生的资助。{1}

3月10日是出殡的日子，香港前往执绋者竟达五千余人。蔡元培的灵柩最后被安葬在港岛南端的香港仔华人永远坟场。京师大学堂校友叶恭绰书碑刻："蔡孑民先生之墓。"

蔡元培逝世后，国民党总裁蒋介石在陪都重庆主持公祭，红都延安则举行各界追悼大会。毛泽东特发唁电："学界泰斗，人世楷模。"周恩来送挽联："从排满到抗日战争，先生之志在民族革命；从五四到人权同盟，先生之行在民主自由。"

一代学术宗师驾鹤远行，无尽哀思尽留心中。蔡元培的新老朋友、北大门生纷纷撰文悼念这位"学界泰斗"。王云五深情地写下一副挽联："百世导师精神不死，半生知己印象永留。"《哀挽录》中有一联云：

打开思想牢狱，解放千年知识囚徒，主将美育承宗教；

推转时代巨轮，成功一世人民哲匠，却尊自由为学风。