在日本，唐才常、毕永年等人时常拜访孙中山，交流救国的方法，孙中山极诚恳地表示：“如果康有为能够皈依革命真理，废弃保皇成见，不只是两党可以联合救国，我也可以使各位同志成为首领”。这时，唐才常等人正在策划“自立军”起义，孙中山也表示支持。唐才常、林圭等人由东京回国发动武装起义时，梁启超在芝红叶馆设宴饯行，孙中山、陈少白等革命党人也出席，“各自举杯庆祝前途胜利，很有风萧萧兮易水寒的气氛”。林在走前，亲自拜访中山请求帮助，孙中山将他介绍给汉口俄国某商行买办、兴中会会员容星桥。此后林在汉口“得到容很多帮助”。这种相互支持的情况，清廷已经侦察到。曾经栽赃康梁1898年搞变法是“保中国不保大清”，第一个请慈禧太后从颐和园回到紫禁城“训政”的杨崇伊，这个时候又给慈禧太后上了一道密折，内称：“康梁逃难在外，必定依附孙文，此人不除，中华即无安枕之日” 

同为朝廷官僚，比较杨崇伊的一味揣测上意，投其所好，张之洞就显得多多少少“有点人性”。因自立军起事失败，唐才常被捕，据说在武昌两江总督衙门，张之洞曾亲自审问他创立的学堂培养出来的革命学生，心里不是滋味。自立军案被诛者中有不少是两湖书院学生，但在张之洞的奏折中除唐才常“不得不提名上报，其他均隐其名”。后湖南捕获唐才常之弟唐才中，张之洞立即致电湖南巡抚请网开一面，说：“兄弟骈首，实有不忍”。

杨崇伊挖空心思，向慈禧太后表达对大清的赤胆忠心，结局却并不好，不但没有受到重用，反而被永远“丁忧”在了老家——自从他因丁忧回籍守制，清政府就再也没让他回到官场中去。