澳大利亚客人也了解到，同仁堂除了“配方独特”和“选料上乘”之外，还坚持了“工艺精湛”的特点。而“工艺精湛”的要点，又是“炮制依法”、“净料投料”。

所谓“净料投料”，就是所用药材都要进行精选，并要求达到洁净，从而保证药品的质量和疗效。精选的主要方法就有筛、簸、挑、刷、剔、剁、刮、搓、碾、劈以及洗、漂、泡、淋、闷润等多种。

所谓“炮制依法”，就是严格按照要求炮制。同仁堂至今保留着五十多种炮制方法。有些要求非常特殊，炮制方法非常独特。比如：“七珍丹”中的“寒食”，必须在春天柳树发芽时制造；牛黄清心丸中的“胶枣肉”（乌枣），要到干果市场购买质量好的乌枣，自己加工去核。参茸养生丸中的“江米酒”必须由本厂自己发酵制造，等等。金银花、野菊花、旋复花等必须用手在花蒂处摘除花梗。远志根如竹筷，而芯如牙签，去芯时要先把远志闷透变软，再用刀割开皮，一根根抽除其中坚韧的木质部；菟丝子是一种类似小米粒大小的种子，为了去净种子的泥土，必需采用特殊的方法漂洗达三次之多。还有些炮制方法，过去是同仁堂的“绝活”，现在仍是受法律保护的“技术秘密”。正因为同仁堂有这些特殊的炮制方法，并且坚持“炮制虽繁必不敢省人工，品味虽贵必不敢减物力”，才能保持自己的产品质量好，药效显著。

同仁堂集团一向遵循“继承不泥古，创新不离宗”的宗旨。因此，除了继承传统，更有创新，现在的同仁堂对“工艺精湛”有了更科学、更严格的要求。

早在２０世纪８０年代，同仁堂就引入了ＴＱＣ，也就是“全面质量管理体系”。９０年代，为了取得国家医药管理部门颁布的ＧＭＰ认证，同仁堂又投入了大量财力、物力、人力，并且对职工进行了培训。从１９９７年开始，同仁堂就有多条生产线通过了国家ＧＭＰ认证，同仁堂制药厂的蜜丸车间就是国内中药企业中首批通过认证的生产线。正因为有了这样的基础，同仁堂才有申请外国ＧＭＰ认证的基础和信心。

澳大利亚客人们在考察中得知，乐达义毁箩的故事在今天的同仁堂再也不会发生了。因为同仁堂按ＧＭＰ的要求，使用了先进的设备，建立了完善的质量监督体系，生产过程中有微小的变化，也会及时发现。而且，现在同仁堂已经有了超细微粒生产技术，即使当时用的最细的１２０目和１６０目箩，也箩不出这么细的药面来。

制度是质量的保证，同仁堂原本就有许多规章制度。供奉御药时的成药或药材，不仅同仁堂自己严格检查后，才能送进宫里，而且每次进药，都要由御药房的两名吏目验收，有时还要由皇帝亲自查验后，才交御药房保管。同时还设立了来往于宫廷和同仁堂之间的专职人员——“药商”。药进到宫中后，只能交给指定的人员，不能经其他人之手，这一切都是为了保证在中间环节不出问题。

现在虽然没有御药房吏目的验收，更没有皇帝的亲自鉴定，但同仁堂有一套远比那时先进、完善、严格的检验程序和相关制度。以进货来说，每批药材在进货前都要报检，经检验合格后才能购进。在生产前，要按制定好的标准进行严格的检查，不合格的决不能投产。此外，还有针对不同生产工序制定的半成品质量标准，以确保不合格的半成品不会流向下道工序。生产完成后，成品要按企业内控质量标准检验，同仁堂的企业标准高于国家标准，达不到企业标准的药品就被视为不合格产品，坚决不准出厂。