从1965年冬天起，到1966年5月，杨尚昆、罗瑞卿、彭真、陆定一以莫须有的罪名，先后遭受诬陷迫害。

聂荣臻从事态的发展中，逐步感受到了这是些不祥的预兆。

1966年春天的杭州之行，加深了他在这方面的印象。

4月17日至25日，由毛泽东主持，在杭州召开了第二次中央政治局常委扩大会议。

聂荣臻出席了这次会议。

出席会议的有：毛泽东、周恩来、刘少奇、林彪、邓小平、彭真、陈毅、聂荣臻、叶剑英、康生、陈伯达，以及各中央局及有关方面的负责人李井泉、陶铸、李雪峰、宋任穷、刘澜涛、萧华、江华、汪东兴等，共二十多人。

会议的内容和决定，实际上都体现在5月16日中央政治局扩大会议通过的《中国共产党中央委员会通知》(简称《五·一六通知》)中了。

聂荣臻在杭州参与讨论这个文件的时候，是很不理解的。

首先，围绕着《海瑞罢官》、《二月提纲》的争论经过，他由于过去很少接触这方面的问题，理不出个头绪来。

其次，聂荣臻与彭真是老战友，对彭真上纲到指名道姓，说他是“赫鲁晓夫式的人物”，这样的结论，聂荣臻难以接受。

三是，对《二月提纲》的批判，上升到是两个阶级两条道路斗争的高度，他也无法理解。

5月21日，即《五·一六通知》通过后的第五天，又发生了国防科委副主任安东突然逝世的事情。

更加加深了聂荣臻的不祥之兆的感觉。

安东，14岁参加革命，参加过两万五千里长征，1955年，37岁时就被授予中国人民解放军少将军衔。

他才思敏捷，精明强干。

聂荣臻很喜欢这位年轻得力的助手。

在聂荣臻的推荐下，安东担任了总参谋部装备部副部长、国防部航空工业委员会秘书长，国防科委秘书长、副主任。

从国防科委成立起，一直主持国防科委的常务工作。

21日中午，聂荣臻散步时边走边叹息说：“安东今年才48岁，喜欢体育运动，会打乒乓球、网球，爱滑冰、游泳，经常锻炼身体，健康状况一直挺好。

怎么这样突然地去世了，真是可惜!”当天晚上，他接到报告说，北京医院尸体解剖的结论是，安东不是死于心脏病，心脏只有轻度病变，而是因为误服了大剂量的眠尔通，导致中枢神经麻痹才死亡的。

一位担任大军区级职务，又掌握着导弹、原子弹等高度机密情报的高级干部，突然非正常死亡，聂荣臻说，这可不是好兆头。

安东非正常死亡的原因始终没有搞清楚，1973年，国防科委党委在报经中央军委批准以后，为安东作出了没有政治问题，按病故人员对待的结论。

《五·一六通知》下发以后，极“左”思潮在神州大地上迅速蔓延，有些地方，对人的迫害到了疯狂的程度。

聂荣臻感到，危险正日益向科技界的知识分子逼近。

不仅发生了安东非正常死亡的事情，6月2日，发生了中国科学院的某位知识分子，出访荷兰时，在所住的旅馆跳楼，抢救无效身亡。

7月6日，中国科学院数学所的某位知识分子，刚由大庆回到北京，也跳楼身亡。

不久，上海市科委主任舒文向聂荣臻报告，上海市科技界的知识分子，近期发生了8起自杀事件，其中有5人身亡。

这一连串的事件，使聂荣臻深感不安。

作为知识分子的知心朋友，在知识分子面临困境的时候，聂荣臻不会无动于衷。

于是，他决定在调查研究的基础上，拟定出一个保护知识分子的文件。

文件被定名为《关于在文化大革命中对待自然科学工作者的几个政策界限》的草稿(以下简称草稿)。

“草稿”共约3000字，主要包括以下内容：一、科技界的绝大部分知识分子，属于无产阶级或资产阶级左派、中派，应该予以团结保护，要打击批判的只是少数右派；二、即使是右派，还能做点科技工作的，也要给以长期的教育改造，使其悔改，重新做人。