蒋梦麟在中西学堂里首先学到的是一件不可思议的地圆学说，因为他向来认为地球是平的。接着老师又告诉他，闪电是阴电和阳电撞击的结果，而不是电神的镜子里发出来的闪光；雷的成因也与此相同，并非雷神击鼓所生。这简直使蒋梦麟目瞪口呆。从基本物理学他又知道雨是怎样形成的。巨龙在云端张口喷水的观念只好就此放弃。了解燃烧的原理后，蒋梦麟又放弃了火神的观念。过去为他所崇拜的神佛，像是在烈日照射下的雪人，一个接着一个地溶化了。这是蒋梦麟了解一些科学知识的开端，也是他思想中怪力乱神信仰的结束。他在乡村里所养成的研究、观察自然的习惯，在这里得到继续发展和发挥的机会。他还是像过去那样强于理解而不喜欢记忆，凡是合理的新观念他都乐于接受，对记忆的旧观念则弃如敝屣。似乎也正因为他喜欢理解而不喜欢记忆，因此他在中西学堂的那两年中，他的考试成绩几乎一直在中等甚至中等以下。他在学校中显得庸庸碌碌，较之当时已头角峥嵘的一些学生，蒋梦麟无疑略显逊色。

在绍兴中西学堂的两年时间，使蒋梦麟的学问大增。特别是在这时期经过1898年的戊戌维新和戊戌政变的刺激，蒋梦麟更加深刻地理解1894年中日甲午战争的意义，那就是日本终于战胜中国完全是因为日本充分吸收西洋文化学术的结果，因此中国人如果真的能像曾在绍兴卧薪尝胆20年的越王勾践那样，生聚教训，周密计划，充分吸收西洋文化学术的长处，中国就一定能够战胜日本，重建中国人的辉煌。