美国独立战争的发生，也是因为早期移民北美的多数人都是新教教徒，而主要殖民地多是清教教徒的缘故。

清教徒是信仰新教中卡尔文主义的英国教徒，之所以被称为清教徒，是因为这些人主张清除英国国教中的天主教因素和影响，净化英国国教，建立纯正的新教教会。英文中的清教徒（Puritan）、清教主义(Purism)就含有清纯、净化的意思。稍微熟悉宗教史的人都知道，英国国教圣公会虽然号称信仰新教，但因其来路暧昧，所以带有很深的天主教痕迹和影响，基本上可以说仍然是天主教体系。当初宣布英国国教改为新教的，是国王亨利八世。亨利八世宣布改宗，并不是因为信仰新教，而是为了摆脱禁止他离婚的天主教会的束缚。该国王因为想废除生不下男孩的王后，离婚另娶，但被反对离婚的天主教教会所禁止，因此，一怒之下，宣布国教改为新教，新教则同意了他的另娶计划。这样改宗的英国的国教教会虽然号称新教，但仍保留了大量的天主教的信仰和习俗，这些天主教的信仰和习俗，一直是国教教会内部真正的新教徒不满和改革的对象，新教徒因此发起了改革教会的运动，他们将自己的改革运动称为净化国教的运动。

但这个运动一开始就遭到了掌握着政权与教权的政府和国教教会的镇压和迫害，在镇压和迫害当中，大量的清教徒逃到了真正的新教国家荷兰，前面讲的最先到达美洲的“五月花号”的人群就是在此背景下逃出的清教徒。留在英国本土的一部分清教徒则与教权和政权继续做着周旋与斗争，最后，在各种政治、经济因素促发下，发生了英国的著名的清教徒革命，清教徒掌握了政权，建立了共和制政体。在清教徒领袖克伦威尔死后，保皇党复辟，英国恢复了旧体制。

由逃亡的清教徒们建立的美洲殖民地，在宗教上，一直与英国本土的宗教处于对立状态。

美洲大陆的宗教主流为清教徒和路德宗，英国的国教则为天主教与新教的混合体圣公会安立甘宗。安立甘宗作为英国国教就如前面所说一直是清教徒改革的对象。在美国独立战争及18世纪20年代，英国本土和美洲殖民地发生了一场轰轰烈烈的宗教“伟大复兴（Great Awaking）”运动，这场运动，表现在英国，是卫理循道宗教派的产生，虽然此教派也反对安立甘主义，力图改革英国国教，但与清教徒教义很多地方截然对立，没形成多大势力，英国仍然被国教控制。这场运动表现在美国，则是新教教义的普及和强化运动，是一场彻头彻尾的新教教义在新大陆被强化的运动，这场运动最后导致了新教公理宗、长老会、浸信会的进一步振兴，这些全都是承袭了清教徒主义的教派，从而与英国国教在思想上彻底脱离了关系，并形成了进一步对立。

宗教“伟大复兴”运动进一步促进了美洲殖民地人群的主体意识，进一步加强了殖民地与英国本土在宗教上和政治上的离心力，为独立战争做了思想和意识形态的准备。