同年八月，白杆军于山海关附近遭遇八旗。

激战中，“祥麟目中箭，尤拔矢逐贼，斩获如故，敌惊退”。

战后，明嘉宗钦赐“忠义可嘉”匾额。

赐良玉诰命夫人，进二品官服。

同年九月，永宁宣抚使奢崇明叛明，据重庆，攻合江，破泸州，陷遵义，建国号“大梁”。全蜀沸腾！

秦良玉奉命回师平叛。仅用两年时间，白杆军收复新都、重庆，解围成都，连克二郎关、佛图关，于天启三年平定全川。

秦良玉因功授都督佥事，充四川总兵官。

崇祯三年，后金进攻大明，永平四城失守，京畿震动，崇祯召天下兵马勤王。

各地将领或自保不暇，或畏缩不前，独秦良玉慷慨誓师，率军昼夜兼程，驰援京师。

京城解围之后，崇祯平台召见秦良玉，赐彩帛羊酒，晋封为都督同知，挂镇东将军印。

崇祯四年，再战大凌河，秦良玉建“首功”。

崇祯七年，张献忠入川，白杆军屡次将其击败，使农民军退走湖广。