1946年4月，黄鼎臣根据中共华南分局的指示，应陈其尤邀请亦到达香港，并出席了致公党中央干事会会议。黄鼎臣指出：“在中国历史的转折关头，中国致公党面临着向何处去的问题，在革命与反革命的生死搏斗中，中间党派没有中立的余地。”因此，建议致公党参加中国共产党领导的新民主主义革命。对此，陈其尤深表赞同，并亲自介绍黄鼎臣加入致公党，参加致公党的改组工作。

经过长时间的筹备工作，中国致公党第三次代表大会于1947年4月29日至5月1日在香港召开。会议决定加入中国共产党领导的人民民主统一战线，并选举产生了新的领导机构，李济深当选为中央主席（对外不公开），陈其尤为副主席，实际负责致公党的领导工作。以此为标志，中国致公党从一个旧式政党转变为一个新型政党，成为人民民主统一战线的重要一员。

致公党“三大”后，陈其尤作为民主运动中的一名勇猛斗士，积极投入到反蒋斗争的洪流之中，为推翻国民党蒋介石的反动统治，配合人民解放战争的胜利发展，做出了重要贡献。

1947年8月19日，针对国民党政府颁布《总动员法案》，陈其尤领导的致公党发表《为反对国民党政府“总动员法”告全体党员书》，一针见血地指出：“总动员法”所含有的内容无一而不是害国害民的，它把和平之门永远关闭，决心与人民为敌到底，这究竟是何居心？“国民党政府前途之黯淡，亦于此可见了。”

1948年3月1日，为教育和帮助广大致公党党员更好地认清形势，表明自己的政治态度，陈其尤发表《认清现实，不要犹豫》一文，指出：“为了人民的利益，我们不畏惧南京独裁政权任何污蔑，说我们偏袒中共也好，做中共的尾巴也好，一切都由他罢，事实总是事实。”“为了中国人民的利益，我们只有彻底地消灭南京的卖国独裁统治，没有让我们中立的空间，更不容我们有犹豫的时间。”