自私基因居然被作为可信的解释，这近乎荒唐。它无法让我们找到导致演化改变的根源，那就是智能细胞。DNA无法控制基因是如何对环境作出反应的，有人会说那是因为DNA是聋的、哑的、看不见的，它们只是被动地待在细胞里。当RNA（核糖核酸）为了细胞生长而合成酶和蛋白质时，DNA也在复制自己，在这一系列的化学过程中，基因没有机会去看外面的世界，去决定是自私还是无私。对自我牺牲唯一合理的解释，就是要加入唯物论者所憎恶的因素：意识。

一只蜜蜂会为了更高尚的目的而牺牲自己，即牺牲部分保全整体。人类的身体也是如此。例如，白细胞在杀死侵入体内的细菌后就会死去。我们体内每个细胞的寿命都已经被设定好，从皮肤细胞和胃细胞的几周寿命，到部分脑细胞与人体寿命相等。整体比个体重要的原则可以扩展到整个地球。生态系统的目的是维持自身，而不是某种特定的植物或动物。当然，在这一体系内，几十万种生物可以同时生存，即使有些物种本身是天敌。

一个毫无意识的进化机制无法解释生命是如何进化和繁荣的。生命中存在着太多的相对性，比如合作和竞争、自私和无私总是同时存在。事实上，整个自然界随时都作着有意识的决定。并非只有进化论的批评者发现了这一理论的缺陷。现在，即使进化论的支持者也已经对最初的理论提出了11种新的解释和修订。每一次修订都试图弥补其中的不足，或修改其中的错误。比如，倡导渐进式进化论的阵营试图解释有限的基因是如何进化成无限的生命形式的。人类只有2.3万个基因，其中有65%的基因与香蕉是完全一致的。这些进化论者仔细研究了生长发育过程，他们也因此得到了一个绰号——进化发育生物学家，他们发现这些看似只是随机排列的DNA时而辅助基因的激活，时而遏制它被激活，就像是一只“分子手指”一样，控制着所有基因的开关，正因如此，子宫中的胎儿才会成长为独特的个体。

进化论的另一个阵营就是集体主义者，他们认识到进化需要竞争，同样需要合作。他们强调植物能从单细胞进化到真核细胞，或多细胞得益于它们的合作原则——光合作用。而严格的进化论者有理由抵制这一观点，因为合作违背了基因自私的观点，直到经过21年的辩论之后，合作才逐渐被人们接受，也被作为生命进化的基础。

还有一些阵营力图解决其他疑惑。复杂理论家力图研究一个体系为何会自发地日益复杂化。没有这一能力，单个的受精卵无法演化为50万亿个细胞（这是最接近普通成年人的细胞估算数量）。而所谓的定向论者则力图从复杂性和合作的相互关系上去研究这一问题。20亿前两种单细胞生物开始合作，直到今天遍布整个星球的所有生物都在互相影响。还有另外7个阵营则努力在进化论的基础上加上生物工程、智能设计、上帝和形而上学的观点，看哪种更符合事实。所有这些研究者都想彻底弄清楚进化的机制。