1949年李宗仁代总统后，孙科辞行政院院长。尽管蒋介石已下野，但李宗仁深知新内阁首长必须得到蒋的首肯，才能获得通过。而论地位和交情，也只有黄埔背景的何应钦有此条件。李宗仁即提名何应钦出掌行政院。

何应钦最初的反映是诚惶诚恐，不敢接受，生怕引起蒋介石的误会。对此反映，蒋介石都认为“未免太过”。据蒋3月10日日记载：“礼卿与文白来庵告敬之电话，坚决拒绝不参加行政院，并闻德邻昨夜二致电话于敬之，皆不理之。其副官接话者亦语多不敬，因之德表示愤慨。” 此时的何应钦已有20余年未直接带兵，不可能对蒋造成任何挑战。同时为了牵制李的权力，便于遥控指挥，蒋介石明确致函何应钦接受这一职务：“中以为只要于革命前途有益，使旧属官兵有所依托而不致分散，以保全革命硕果之基础，则兄应毅然应命，更不必论职位之尊卑与个人之得失，此为中对革命之基本观念，亦望吾兄能以中之意志为意志，承当此艰危之局势也。”第二天，李宗仁再派白崇禧赴杭州促何应钦组阁时，由于有了蒋的指示，何“始则坚拒，终至允就”。

事实上，何应钦也深知他出掌行政院，不过是一届过渡内阁而已。蒋介石力挺何应钦就任行政院长一职，还有一层深意，就是防止“桂系黄绍竑充任，以中其夺取行政院过渡之阴谋也”。

陈铭枢原本与蒋介石没有太多的渊源。北伐前，他是李济深第4军的一名师长。北伐时，陈铭枢同张发奎分领第4军两个师南征北战，同被誉为铁军。军长李济深则率陈济棠、徐景唐两师留守广东。随着北伐凯歌高奏，陈铭枢、张发奎两师不断扩编，张师继承了第4军番号，陈师发展为第11军。

宁汉分裂后，武汉政府所控制的主要军事力量有唐生智、张发奎和陈铭枢三部，陈还兼任武汉卫戍司令。在武汉政权的反蒋斗争中，唐、张两人都服从武汉中央，唯有陈铭枢支持蒋介石。他在回忆录中曾记下当时的心态：“在反蒋浪潮中，我对蒋介石虽有不满之处，但一考虑到全局和前途，我就是不愿公开附和反蒋。此外，我对当时中共领导下的工农运动，也认为越轨过火。” 为此，陈铭枢放弃武汉卫戍司令之职，只身投奔南京，出任政治部副主任（主任吴稚晖，但不到部，实际由陈负全责）。其部队暂时归张发奎指挥。

1927年8月，宁汉合流，蒋介石下野，陈铭枢也随之辞职出洋。出发前陈铭枢曾主动到奉化拜访蒋介石，商谈时局。据蒋日记载：“真如主张我出国游历，甚有见解也。” 不久，蒋介石接受陈铭枢的意见出访日本。在日期间，蒋介石还特意“往汤本访真如”。

自陈铭枢脱离武汉后，他的基本部队因不满张发奎而参加了中共领导的南昌起义，但不久即由蔡廷锴率领脱离起义部队，南下福州，重建11军。陈铭枢得知消息后立即由日本回国，重掌军队。此后，国民党内爆发了数次反蒋战争，例如蒋桂战争、中原大战，陈铭枢都以自身实力鼎力拥蒋，成为非蒋嫡系的地方实力派中独一无二的挺蒋劲旅。作为回报，蒋介石特命陈铭枢为广东省政府主席，他掌握的部队也扩编为第19路军。

在宁粤对峙期间，国民党内粤籍领袖几乎全部投入反蒋阵营，唯有陈铭枢率领的这支以粤人为主的第19路军，公开支持蒋介石，助蒋稳定权力，立下汗马功劳。九一八事变后，在蒋阵营中唯有陈铭枢是握有实力的广东人，得以充当宁粤之间的调停人。粤方甚至提出上海和谈的前提条件，是任命陈铭枢为京沪卫戍司令，并将以粤人为主的“十九路军调宁后，粤代表方北上；俟在沪商有头绪，粤委始赴京”。 此后，在陈铭枢的协助下，蒋介石成功地拆散了粤方内部的团结，并将粤方重要人物孙科和汪精卫从粤阵营中分化出来。 陈铭枢也因调解宁粤有功，出任新成立的孙科内阁行政院副院长，达到他个人在民国政坛上的最高峰。