智顗在玉泉寺四年，主要讲《法华玄义》和《摩诃止观》，然后由灌顶记录整理成书，成为天台宗的主要经典。《法华玄义》是对《法华经》的理解，《摩诃止观》是讲禅法的。摩诃是梵文，意为大，“止”为停息，“观”是智慧。是指教理与修证两大部门，称教观二门。

看来智顗是一心要在创立宗派上做文章的，在江都，只能是杨广的家僧，所以他要离开。他在这里收了很多弟子。据说他一生造寺三十六所，度僧一万四千余人，亲传弟子三十二人。在玉泉寺就有不少。大概是他比较开心的时候，讲《妙法莲华经》一个“妙”字，能讲九十多天。

开皇十三年（公元593年）二月二十二日，杨广入朝，行至陕州（治所今河南陕县），又遣使送去亲笔信往荆州奉迎智顗，称自己“驰仰之诚与时而积”，越来越想念了。

五月，智顗派弟子奉书报晋王，送上新建玉泉伽蓝（寺庙）图，献上相传是外国献给梁武帝的珍贵“万春树皮袈裟”。杨广收到礼物后就修书一封表示感谢，并以丰厚的礼单表示回报。文帝也敕书匾额，赐智顗创办的精舍名曰“玉泉寺”，并敬问道体，也就是身体如何。

荆州继任总管王积慌了神，急忙随即到山上礼拜，境况大为改观了。据说王积上山礼拜，见到智顗后浑身出汗、颤抖。王积身经百战，未曾怵过，此次竟会这样，令人非常不解。

杨广始终想着要智顗入江都。又三番写信派人迎接智顗，一定要见到师父。没有办法，智顗只好在595年二月到了金陵。

智顗始终不愿住进慧日道场，先到金陵栖霞寺，后又来到江都城外禅众寺。大概就是不愿做杨广的笼中鸟。面对智顗的风骨，杨广转而希望大师传授佛法。两次修书向智顗问禅法，很可能想成为智者传灯弟子，智者频辞不免，乃著《净名经疏》，此经疏是对《维摩诘经》作的注解。

七月，智顗以所著《净名经疏·初卷》奉送晋王，杨广很高兴地接受了，但他进一步要智顗授禅传灯却遭到了断然拒绝。其后一段时间，智顗的活动受到了监视。这从他去世前写给杨广的信中可以看出。“今出期既断，法门亦绝。”不让他出去传法，法门就绝了。他很愤慨，这是信中“六恨”之一，也是人们对智顗死因猜测的一个依据。