王鹤滨被调到中南海初期，住在南海北岸上的“静谷”大院，即丰泽园的西邻、勤政殿边上的西八所。在丰泽园大院的偏东侧，就是毛泽东居住和办公的地方——菊香书屋。书屋所在的院子向北有五间房，中间的一间有过厅，大门上有一块横着的木质匾额“紫云轩”。进入紫云轩，东侧的两间北房通间便是毛泽东的起居室了。据介绍，毛泽东进入北京城中南海直到“文革”前，多半是在这紫云轩度过的。“我在主席身边工作时，他也曾在万寿路的新六所或玉泉山住过，但都是暂时性的。”王鹤滨说。毛泽东最喜欢住在紫云轩里，住在这里主席有一种“家”的感觉。

菊香书屋的南厢房名为“松寿斋”，主人是江青；东厢房的南院是“云山画”，是毛泽东子女们的集体宿舍，住着毛泽东的女儿李敏、李讷、儿媳刘思齐、侄子毛远新和江青的姐姐李云露及其儿子王博文。因为孩子们上学都是住校，但只要孩子们一回来，“云山画”就是整个大院里最活跃的地方，总能听到唧唧喳喳的欢笑声。

20世纪50年代初，有关领导考虑紫云轩光线不足，不利于毛泽东工作和健康，就想改造一下，但是毛泽东始终不同意改建中南海的建筑，说这是文物建筑。然而，在毛泽东一次外出工作期间，有关部门在没有请示毛泽东的情况下（担心请示后不同意），就自作主张改建了毛泽东的起居室和春耦斋。虽然没有大的破坏，也基本保持了原貌，但是毛泽东回来后发现木已成舟，非常气愤，一怒之下搬出了紫云轩，住进了游泳池。毛泽东住的是游泳池的附属房间，虽然不便于生活和工作，可是他一住就是几年。几年后，毛泽东的怒气逐渐消减，才回到紫云轩居住。

毛泽东曾在玉泉山住过。当时为了毛泽东锻炼身体的需要，未经他的同意工作人员便在他的住所建了一个游泳池。毛泽东知道后，感觉自己特殊化了便离开了玉泉山。

尽管王鹤滨是毛泽东的保健医生，但还兼顾其他中央首长的保健任务。“总理的工作是最忙的，也是最辛苦的。我到西花厅去时，经常看到总理坐在马桶上还得要办公。为了安排国家的大事和外事活动，他常常是在主席入睡以后才去休息。因此，总理经常通电话给机要秘书室，甚至直接给主席的卫士值班室打电话，了解主席的生活、工作情况。这样一来，总理入睡也要经常靠安眠剂的帮助了，这好像也是中央领导层中多数人的通病。”

刚进中南海不久，王鹤滨第一次为周恩来看病。那天，傅连暲带着王鹤滨和金茂岳去给周恩来检查身体。周恩来经常流少量鼻血，这虽然不是什么大毛病，但总是一种折磨，他也没有更有效的办法，就用盐水棉棒擦洗的方法，来减轻这种折磨。经过检查，王鹤滨发现周恩来鼻中隔左侧的黏膜上，有麦粒大小的浅表性溃疡面。王鹤滨把自己检查到的情况，向周恩来、傅连暲、金茂岳讲了，周恩来问：“如何治疗呢？”“可以用硝酸银轻轻地腐蚀一下，以促进溃疡面的愈合。”王鹤滨认为处理起来并不难。周恩来听后，带着微笑表态说：“那好啊！就试试看吧！”可金茂岳当即表示反对：“不行！不要把鼻中隔腐蚀穿了！”王鹤滨觉得金茂岳是妇科专家，这方面的治疗可能没有经验，但他是位老大夫，不好与他争论。傅连暲没有表态。这等于是把王鹤滨的治疗方法否定了。许多年后，王鹤滨回想此事时说，如果他那时业务水平高些，一剂中药便可以把这点儿小病治好，就不会让周恩来一生受此小病拖累了。