袁世凯综合各方意见，令国务院电陆荣廷批准这一方案：“奉大总统令，号电悉。前电宣布都督议会暨法制铨叙两局，随同建设，六司居桂。是为调停桂邕内讧起见，自应切实遵行，以免再有争执，该都督以民政财政最关重要，电饬该两司长亲到会场，宣布政见。余司仅令派员赴会，既使政府得议会联络之益，又不背原电六司居桂之旨，办理妥协，无任欣慰。希抱定宗旨，力予维持，以后关于各司应迁应留，一听议会公决。如有妄肆蜚言，淆惑观听者，应由该都督依法办理。”陆荣廷接电后，即转电到桂林广西都督府，转电告桂林议员赴邕开会。1912年8月28日，陆荣廷携都督府参谋长林绍斐、秘书朱为潮到南宁，并亲临迁往南宁的省议会发表讲话，说：“议会为代表民意的机关，必能发扬民权，为社会造福。本人受全省父老重托，自当绝对尊重民意，一切以民意为是，维护民主利益，尊重议会决定。”

10月17日，议会正式表决“迁省”案，到会八十三人，赞成者七十人，获多数通过，南宁从此成为广西省会。11月，民政司首先迁来南宁，其他各司在第二年陆续南迁。历时大半年、轰动全国的民初广西迁省风潮宣告结束。

事实证明，陆荣廷尊重民意迁省南宁，是目光远大的战略举措。综观整个过程，陆荣廷在迁省之争中始终保持公心，并没有因家乡近南宁而在迁省问题上暗藏私心。迁省之争是广西近代以来在新旧社会选择中的一场碰撞，迁省南宁使得广西各族人民企望的“桂人治桂”得以实现，并促进了广西近代化的快速发展。

值得一提的是，尽管处于迁省风潮的漩涡之中，又在出巡弹压各地民军和土匪的戎马倥偬之中，陆荣廷仍时时关注着新生的民国政权的局势。这时的陆荣廷，对孙中山衷心拥护，其革命性较之当时的各省都督尤在前位。