那时凉州是河西的一个大都会，又是东西交通要道，西域诸国商侣往来，日日不断，听见奘师在此说法，都赶来听讲，无不同声赞叹，并布施许多金银珍宝，他们回去以后，都报告务自的君长，赞叹奘师，并说他将要西来，到印度去取经求法。所以奘师未到西域之前，西域各国早已知道，各国君长大多信奉佛教，听了都暗自欢喜，并准备恭迎奘师的到来。

奘师在法会圆满后，面对堆积如山布施的珍宝物品，只拿了一半作为供养佛的香油钱，另一半转赠凉州各寺庙。

当时唐朝的政权，尚未完全巩固，西北一带边境，常常遭受西突厥的威胁，所以封锁边境，不准百姓私自出境。凉州都督李大亮奉命守关，一天忽然有人报到，说有一个僧人从长安来，要到西天去，不知何意。李大亮得知，派人追上奘师，问他来由。奘师说道：“要西去取经。”李大亮不肯，逼他回京。奘师正在进退两难之际，这时凉州有一位慧威法师，是河西一带的佛门领袖，他很敬重奘师的辞理通达，更佩服他西行求法的大愿，便暗中派了两名心腹弟子，一个叫慧琳，一个叫道整，暗中护送奘师偷渡出关。他们不敢公然行走，只能昼伏夜行，走了十几天，终于到达瓜州（今甘肃安西）。

瓜州刺史独孤达，是一个虔诚的佛教徒，一听说奘师来到，非常欢喜，供养优厚。奘师向其询问前往西域的路线情形，当下有人报道说：“由这里向北走约五十余里，就到瓠卢河（今疏勒河），上窄下宽，水流湍急，深不可测。河岸设有玉门关，是必经之路，也是通往西域的咽喉，可是法师你没有通关的度牒，只怕出不了关。即使侥幸混出关了，沿途还有五座烽火台，各相距一百里，每一座烽火台上，都住有守兵，监视着往来行人；其间尽是沙漠，连水草也没有，要通过也不容易。等过了这五座烽火台，再穿过八百里流沙的莫贺延碛，才会到达伊吾国境（今新疆哈密）。”

奘师听完甚感忧虑，心想此去路途艰险，不知如何是好。不过，他仍然不失望，心想：“那就再多等几天吧！好好祈求诸佛菩萨加持。”结果这一等就是一个多月，连从长安一路上陪着奘师受苦受难的马，也在这段时间因病死了，这使奘师不禁感到悲伤万分。

正在奘师等候期间，凉州的访牒又来了，说是有一个叫奘师的和尚，私自出境，命令沿途各州县严加捉捕，务必解送京师。幸好州史李昌，是个崇信佛法之士。他接到这件公文，马上怀疑公文指名要捉拿的人就是奘师。他立刻秘密带着公文前去拜访奘师，问道：“法师是不是牒文中所说的玄奘法师？”奘师心下犹疑不敢回答。李昌说道：“法师请实说了吧，如果是，我一定为你想办法。”奘师便告诉了实情，李昌听了，深为佩服，立起身来，将文书一撕两半，并劝他道：“夜长梦多，请法师及早动身。”

李昌走后，奘师越发愁闷了。慧威法师派来随行的两位小僧，道整已先去了敦煌；而留下来的慧琳又不堪长途跋涉，只好把他遣回凉州。自己虽买了一匹马，但苦于无人引路，因此日日在弥勒菩萨像前祈求，希望能得一人引渡过关。有天晚上，寺里一名叫达摩的胡僧，梦见奘师坐在莲花上，向西而去。达摩觉得很奇怪，隔天一早，连忙前来向奘师报告梦中所见之事。虽然此事被奘师斥为虚妄，然而奘师心中却暗自欢喜，认为这是即将成行的好预兆，于是进入道场，更加诚心礼求。