当三人到达斯大林的办公室时，里面只有斯大林一人。很显然，他显得有点焦虑不安。

斯大林说：“这名德军叛徒可能是德军将军们派来挑起事端的。”

铁木辛哥回答道：“不，我们认为他说的是真话。”

正在此时，政治局的委员们走了进来。

斯大林问：“我们应当怎么做？”

办公室内一片沉默。

铁木辛哥说，我们必须立即向所有边防部队发出一道战争戒备命令。

斯大林说：“读来听听。”

朱可夫随后将命令草案读了一遍。

斯大林在听完以后说：“现在发布这样一条命令有些为时过早，这个问题或许能够通过和平手段来解决。我们必须准备一份简短的命令告诉边防部队，德军可能发起挑衅性的进攻。为了避免使问题复杂化，各边防军区的部队一律不得轻举妄动。”

随后，朱可夫和瓦杜丁走进隔壁的一个房间，开始起草一份发往各边防军区的命令。回到斯大林的办公室后，斯大林要求他们把命令再当众朗读一遍。斯大林在仔细聆听的同时，口中也在不停地重复，并对命令作了修改。然后，铁木辛哥和朱可夫在上面签了字。

１９４１年６月２２日拂晓，德军从三个战略方向对苏联发动了闪击战。战后的各种报道说，当德军发起进攻时，许多苏军指挥官不是在沉睡就是在寻欢作乐，根本没有意识到他们的国家即将大难临头。朱可夫直截了当地指出，这些报道是没有任何根据的。但是，德军在６月２２日的第一轮进攻确实让苏联大吃一惊、措手不及，在这一点上历史学家们没有任何争议。

德军的地面和空中攻势异常猛烈，给苏军以致命性的打击。数以百计的苏军战机被逐出天空，无数苏军飞行员在战斗中丧生。德国陆军元帅阿尔伯特·凯塞林后来描述道，消灭他们简直像“杀死婴儿”一样容易。

在德军入侵的第一天下午，朱可夫接到了战争爆发后的第一项任务。斯大林打电话告诉他：“我们各个方面军司令员缺乏足够的作战经验，很明显，他们目前有点惊慌失措。我们已经决定派你前往西南方面军担任最高统帅部的代表，请将总参谋长的工作移交完毕后立即飞往基辅，那里危在旦夕。”当朱可夫询问谁将取代他在总参谋部的职位时，斯大林非常生气，呵斥道：“不要浪费时间，瓦杜丁将顶替你的职位！”

朱可夫写道：“我打电话告诉家人不必等我了。４０分钟后，我已经坐上飞机。就在那时，我才想起，从昨天到现在，我还没有吃过任何东西。后来，飞行员给我端来了浓茶和三明治。”

对于朱可夫而言，一场前后历时１ ４１８个昼夜的战争开始了。

战争打响后的前几个星期，朱可夫的生活非常紧张，经常每天工作２０多个小时。为了不至于犯困，他经常不停地喝着很浓的咖啡，有时还会在战场的雪地上滑上一刻钟的雪。在这段时间里，朱可夫一直在夜以继日、废寝忘食地工作：研究军事地图、给前线指挥官发电报、起草作战命令、与高级参谋人员讨论战术、批评指正他们的错误、更换不称职的指挥官……他经常在各个战场上往来穿梭，对于那些慌乱不堪、办事不力的指挥官，他都予以严厉的批评和训斥。据说，对于逃兵和胆小鬼他从不手软，下令立即就地正法（他的机动警卫部队在人数上比往常增加了一倍，用来作为执行死刑的射击队）。通常情况下，在他所到之处，部队的士气和信心都会因为他的出现而大增。同时，朱可夫还经常与斯大林见面，虽然他曾经一度十分敬畏斯大林，但是在他的眼里，斯大林并不是像别人吹捧的那样伟大。朱可夫很快就意识到，“伟大统帅”也并不是永远正确。很多情况下，当朱可夫和斯大林在里面争吵时，在克里姆林宫外面等待斯大林接见的官员都为之感到恐慌。在斯大林的高级将官中，敢于直接顶撞他却能幸存下来的人屈指可数，朱可夫是其中最有名的一位。在整个战争期间，朱可夫和斯大林始终保持着一种工作上的关系，两人都努力地互相尊重对方，但是他们的关系一直未能上升到友谊的高度。朱可夫发现，斯大林是一个喜怒无常、脾气暴躁的人。从最高统帅手持“登喜路”烟斗的姿势、是否点着烟斗、是否刮胡子、甚至穿着的睡衣方面，他学会了如何辨识斯大林的情绪。