后来，大家在合议如何处理大院君李昰应时，袁世凯所处地位虽然低微，但贡献不小。“诱擒大院君之议虽出于薛福成，但临机决策，张謇的贡献为大，袁则在实际的行动方面出力颇多。”吴长庆先拜访李昰应，“好言诱之”，李去戒备之心，次日驾临黄仕林营中答拜。吴长庆等先诱其入帐慢谈，袁世凯则以计阻止大院君之护从人员。随后，吴长庆擒拿下大院君，并由丁汝昌连夜送到南阳府，再由兵船押往天津。为了免于滋生更多事端，袁世凯等带上亲兵，雨夜巡视各主要街道和王宫周围，未发现异常后，才回营休息。在接下来的惩治“乱党”中，袁世凯也出力颇多。他先是与马建忠商量如何铲除“乱党”，甚至还主动请命亲任枉寻里之战的总指挥。枉寻里之战结束后，壬午之变算至此平定。

壬午之变平定后，朝鲜国王设宴款待，礼遇袁世凯，甚至为其设立生祠。清政府也对平定“壬午兵变”有功人员进行奖赏，袁世凯因“治军严肃，调度有方，争先攻剿，尤为奋勇”晋官同知发分省补用，赏戴花翎。九月，朝鲜国王派使者向清政府致谢，并要求清政府派出教习，帮助朝鲜训练新式军队。李鸿章命吴长庆筹划。吴长庆派袁世凯、朱先民、何增珠等办理编练朝鲜新军。“草创章制，编选壮丁”，选1000人，分左右营，按淮军操法训练，武器装备由中国供给。朝鲜国王检阅后，极为满意，称赞袁世凯训练有方。决定在江华沁军营中再选500名编为“镇抚营”，仍由袁世凯训练。“袁世凯编练韩军的重要性虽不及他日后的小站练兵，却也具有特殊的意义。这次练军可说是壬午事变后中国在韩势力急剧发展的象征，同时也显示袁世凯在庆军中的地位。”

袁世凯厕身军界，本属无奈之举，但确实天赋所在，在吴长庆的提携之下，短短几年，已锋芒显露，崭露头角。